作者：Ana C. Queiró ; s¹ ; ¹⁹ ; René ; e Beekman² ; ¹⁹ ; Roser Vilarrasa-Blasi¹ ; ¹⁹ ; Martí ; Duran-Ferrer¹ ; Guillem Clot² ; Angelika Merkel³ ; Emanuele Raineri³ ; Nuria Russiñ ; ol¹ ; ² ; Giancarlo Castellano² ; Sí ; lvia Beà ; ² ; Alba Navarro² ; Marta Kulis¹ ; Nú ; ria Verdaguer-Dot¹ ; ² ; Pedro Jares¹ ; ⁴ ; Anna Enjuanes⁴ ; Marí ; a José ; Calasanz⁵ ; Anke Bergmann⁶ ; ⁷ ; Inga Vater⁶ ; Itziar Salaverrí ; a² ; Harmen J.G. van de Werken⁸ ; ⁹ ; ¹⁰ ; Wyndham H. Wilson¹¹ ; Avik Datta¹² ; Paul Flicek¹² ; Romina Royo¹³ ; Joost Martens¹⁴ ; Eva Giné ; ¹⁵ ; Armando Lopez-Guillermo¹⁵ ; Hendrik G. Stunnenberg¹⁴ ; Wolfram Klapper¹⁶ ; Christiane Pott¹⁷ ; Simon Heath³ ; Ivo G. Gut³ ; Reiner Siebert⁶ ; Elí ; as Campo¹ ; ² ; ¹⁸ ; José ; I. Martí ; n-Subero¹ ; ² ; ²⁰ ; ^{imartins@clinic.ub.es" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：epigenomics ; DNA methylation ; lymphoma ; mantle cell lymphoma ; DNA looping ; SOX11 ; enhancer ; ChIP-seq ; chromatin ; whole-genome bisulfite sequencing

刊名：Cancer Cell

出版年：2016

作者：Biola M. Javierre¹ ; ¹¹ ; Oliver S. Burren² ; ¹¹ ; Steven P. Wilder³ ; ¹¹ ; Roman Kreuzhuber³ ; ⁴ ; ⁵ ; ¹¹ ; Steven M. Hill⁶ ; ¹¹ ; Sven Sewitz¹ ; Jonathan Cairns¹ ; Steven W. Wingett¹ ; Csilla Vá ; rnai¹ ; Michiel J. Thiecke¹ ; Frances Burden⁴ ; ⁵ ; Samantha Farrow⁴ ; ⁵ ; Antony J. Cutler² ; Karola Rehnströ ; m⁴ ; ⁵ ; Kate Downes⁴ ; ⁵ ; Luigi Grassi⁴ ; ⁵ ; Myrto Kostadima³ ; ⁴ ; ⁵ ; Paula Freire-Pritchett¹ ; Fan Wang⁶ ; The BLUEPRINT Consortium Joost H. Martens ; Bowon Kim ; Nilofar Sharifi ; Eva M. Janssen-Megens ; Marie-Laure Yaspo ; Matthias Linser ; Alexander Kovacsovics ; Laura Clarke ; David Richardson ; Avik Datta ; Paul Flicek

关键词：gene regulation ; chromosome conformation ; promoter capture Hi-C ; non-coding genetic variation ; disease gene prioritization

刊名：Cell

出版年：2016

作者：Ronald P. Schuyler¹ ; ² ; Angelika Merkel¹ ; ² ; Emanuele Raineri¹ ; ² ; Lucia Altucci³ ; Edo Vellenga⁴ ; Joost H.A. Martens⁵ ; Farzin Pourfarzad⁶ ; Taco W. Kuijpers⁶ ; ⁷ ; Frances Burden⁸ ; ⁹ ; Samantha Farrow⁸ ; ⁹ ; Kate Downes⁸ ; ⁹ ; Willem H. Ouwehand⁸ ; ⁹ ; ¹⁰ ; ¹¹ ; Laura Clarke¹² ; Avik Datta¹² ; Ernesto Lowy¹² ; Paul Flicek¹² ; Mattia Frontini⁸ ; ⁹ ; ¹⁰ ; Hendrik G. Stunnenberg⁵ ; José ; I. Martí ; n-Subero¹³ ; Ivo Gut¹ ; ² ; Simon Heath¹ ; ² ; ¹⁴ ; ^{simon.heath@gmail.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：DNA methylation ; epigenetics ; whole-genome bisulfite sequencing ; hematopoiesis ; CTCF ; nucleosomes ; BLUEPRINT

刊名：Cell Reports

出版年：2016

作者：Lu Chen¹ ; ² ; ²⁸ ; Bing Ge³ ; ²⁸ ; Francesco Paolo Casale⁴ ; ²⁸ ; Louella Vasquez¹ ; ²⁸ ; Tony Kwan³ ; Diego Garrido-Martí ; n⁵ ; ⁶ ; Stephen Watt¹ ; Ying Yan¹ ; Kousik Kundu¹ ; ² ; Simone Ecker⁷ ; ⁸ ; Avik Datta⁹ ; David Richardson⁹ ; Frances Burden² ; ¹⁸ ; Daniel Mead¹ ; Alice L. Mann¹ ; Jose Maria Fernandez⁷ ; Sophia Rowlston² ; ¹⁸ ; Steven P. Wilder¹⁰ ; Samantha Farrow² ; ¹⁸ ; Xiaojian Shao³ ; John J. Lambourne³ ; ² ; ¹⁸ ; Adriana Redensek³ ; Cornelis A. Albers¹³ ; ¹⁶ ; Vyacheslav Amstislavskiy¹⁴ ; Sofie Ashford² ; ¹⁸ ; Kim Berentsen¹⁵ ; Lorenzo Bomba¹ ; Guillaume Bourque³ ; David Bujold³ ; Stephan Busche³ ; Maxime Caron³ ; Shu-Huang Chen³ ; Warren Cheung³ ; Oliver Delaneau¹² ; Emmanouil T. Dermitzakis¹² ; Heather Elding¹ ; Irina Colgiu¹⁷ ; Frederik O. Bagger² ; ⁴ ; ¹⁸ ; Paul Flicek⁹ ; Ehsan Habibi¹⁵ ; Valentina Iotchkova¹ ; ¹¹ ; Eva Janssen-Megens¹⁵ ; Bowon Kim¹⁵ ; Hans Lehrach¹⁴ ; Ernesto Lowy⁹ ; Amit Mandoli¹⁵ ; Filomena Matarese¹⁵ ; Matthew T. Maurano¹⁹ ; John A. Morris³ ; Vera Pancaldi⁷

关键词：immune ; monocyte ; neutrophil ; t-cell ; EWAS ; histone modification ; DNA methylation ; transription ; allele specific ; QTL

刊名：Cell

出版年：2016

作者：Sibnarayan Datta ; Arup Banerjee ; Partha Kumar Ch ; ra ; Avik Biswas ; Rajesh Panigrahi ; Pradip Kumar Mahapatra ; Chinmoy Kumar Pa ; Shekhar Chakrabarti ; Sujit Kumar Bhattacharya ; Runu Chakravarty

关键词：Hepatitis B genotypes ; X gene ; HBV DNA ; Mutation ; Eastern India

刊名：Virology

出版年：2008

作者：Arup Banerjee ; Partha K. Ch ; ra ; Sibnarayan Datta ; Avik Biswas ; Prasun Bhattacharya ; Subhasis Chakraborty ; Sekhar Chakrabarti ; Sujit Kumar Bhattacharya ; Runu Chakravarty

关键词：Occult HBV infection ; AntiHBc only in general population ; Surface gene variant

刊名：Journal of Clinical Virology

出版年：2007

作者：Ghosh ; Avik W. ; Zahid ; Ferdows ; Datta ; Supriyo ; Birge ; Robert R.

关键词：05.10.Gg ; 05.40.&minusa ; 87.10.+e

刊名：Chemical Physics

出版年：2002

作者：Damle ; Prashant ; Ghosh ; Avik W. ; Datta ; Supriyo

关键词：85.65.+h ; 73.23.-b ; 31.15.Ar ; Molecular electronics ; First-principles ; DFT ; NEGF

刊名：Chemical Physics

出版年：2002