作者：Hajime Takahashi ; ^{hajime@kaiyodai.ac.jp} ; Ai Iwakawa ; Chihiro Ohshima ; Daisuke Kyoui ; Shiori Kumano ; Takashi Kuda ; Bon Kimura

关键词：Listeria monocytogenes ; Molecular typing ; Next generation sequencing ; Multilocus sequence typing

刊名：International Journal of Food Microbiology

出版年：2017

作者：Kiran Dashrath Rasal^a ; ^{kirancife@gmail.com} ; ^{Kiran.Rasal@icar.gov.in} ; Vemlawada Chakrapani^a ; Amrendra Kumar Pandey^a ; Avinash Rambhau Rasal^a ; Jitendra K. Sundaray^a ; Arun Ninawe^b ; Pallipuram Jayasankar^a

关键词：SNP ; single nucleotide polymorphism ; QTL ; quantitative trait loci ; NGS ; next generation sequencing ; ESTs ; expressed sequence tags ; GATK ; Genome Analysis Toolkit ; SSCP ; single strand conformation polymorphism ; GBS ; Genotyping-by-sequencing ; SIFT ; Sorting Intolerant from Tolerant ; nsSNPs ; non-synonymous single nucleotide polymorphisms ; AASs ; amino acid substitutions ; PROVEAN ; Protein Variation Effect Analyzer ; PDB ; Protein Data Bank

刊名：Gene Reports

出版年：2017

作者：Lidita Khandeparker ; ^{klidita@nio.org} ; Nishanth Kuchi ; Dipesh Kale ; Arga Chandrashekar Anil

关键词：Metagenomics ; Next Gen Sequencing (NGS) ; Microbial diversity ; Sediment ; Mandovi-Zuari (Ma-Zu) estuarine complex ; Ion Torrent PGM&trade

刊名：Ecological Indicators

出版年：2017

作者：James Chun-I Lee^a ; ^{jimlee@ntu.edu.tw} ; ^{jimlee108@gmail.com} ; Bill Tseng^a ; Liang-Kai Chang^b ; ^{steven.chang@llsc.com.tw} ; Adrian Linacre^c ; ^{adrian.linacre@flinders.edu.au}

关键词：STR ; SNP ; Bioinformatics ; Massively parallel sequencing ; Next generation sequencing ; Forensic science

刊名：Forensic Science International: Genetics

出版年：2017

作者：Katarzyna Pieczul^a ; ^{k.pieczul@iorpib.poznan.pl} ; Anna Wąsowska^b

关键词：Next-generation sequencing ; QoI resistance ; Zymoseptoria tritici

刊名：Crop Protection

出版年：2017

作者：Jingzhong Xie^a ; ¹ ; Naxin Huo^b ; ^c ; ¹ ; Shenghui Zhou^a ; ¹ ; Yi Wang^b ; ¹ ; Guanghao Guo^a ; Karin R. Deal^c ; Shuhong Ouyang^a ; Yong Liang^a ; Zhenzhong Wang^a ; Lichan Xiao^c ; Tingting Zhu^c ; Tiezhu Hu^b ; Vijay Tiwari^d ; Jianwei Zhang^e ; Hongxia Li^b ; Zhongfu Ni^a ; Yingyin Yao^a ; Huiru Peng^a ; Shengli Zhang^b ; Olin D. Anderson^b ; Patrick E. McGuire^c ; Jan Dvorak^c ; ^{jdvorak@ucdavis.edu} ; Ming-Cheng Luo^c ; ^{mcluo@ucdavis.edu} ; Zhiyong Liu^a ; ^{zyliu@genetics.ac.cn} ; Yong Q. Gu^b ; ^{yong.gu@ars.usda.gov} ; Qixin Sun^a ; ^{qxsun@cau.edu.cn}

关键词：Aegilops tauschii ; Genome sequencing ; Sequence assembly ; Comparative genomics ; Grass evolution

刊名：Journal of Genetics and Genomics

出版年：2017

作者：Marilyn M. Li^&lowast ; ; ^&dagger ; ; ^{lim5@email.chop.edu} ; Michael Datto^&lowast ; ; ^&Dagger ; ; Eric J. Duncavage^&lowast ; ; ^§ ; ; Shashikant Kulkarni^&lowast ; ; ^¶ ; ; Neal I. Lindeman^&lowast ; ; ^‖ ; Somak Roy^&lowast ; ; ^&lowast ; &lowast ; ; Apostolia M. Tsimberidou^&lowast ; ; ^&dagger ; &dagger ; ; Cindy L. Vnencak-Jones^&lowast ; ; ^&Dagger ; &Dagger ; ; Daynna J. Wolff^&lowast ; ; ^§ ; § ; ; Anas Younes^&lowast ; ; ^¶ ; ¶ ; ; Marina N. Nikiforova^&lowast ; ; ^&lowast ; &lowast ;

刊名：The Journal of Molecular Diagnostics

出版年：2017

作者：Tahir Usman^a ; ^b ; Frieder Hadlich^a ; Wiebke Demasius^a ; Rosemarie Weikard^a ; Christa Kü ; hn^a ; ^c ; ^{kuehn@fbn-dummerstorf.de} ;

关键词：Unmapped reads ; Next generation sequencing ; RNAseq ; Bioinformatics

刊名：Genomics

出版年：2017

作者：Eric J. Duncavage^&lowast ; ; Haley J. Abel^&dagger ; ; John D. Pfeifer^&lowast ; ; ^{pfeifer@path.wusltl.edu}

刊名：The Journal of Molecular Diagnostics

出版年：2017

作者：Dearbhaile C. Collins¹ ; Raghav Sundar¹ ; Joline S.J. Lim¹ ; Timothy A. Yap¹ ; ^{timothy.yap@icr.ac.uk}

关键词：precision medicine ; biomarker ; next-generation sequencing ; theranostics ; omics technology ; oncology

刊名：Trends in Pharmacological Sciences

出版年：2017