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1.Quantitative multi-target RNA profiling in Epstein-Barr virus infected tumor cells

作者：A.E. Greijer¹ ; O. Ramayanti¹ ; S.A.W.M. Verkuijlen ; Z. Novalić ; H. Juwana ; J.M. Middeldorp ; ^{j.middeldorp@vumc.nl}

关键词：Epstein-Barr virus ; Quantitative RT-PCR ; RNA expression profile

刊名：Journal of Virological Methods

出版年：2017

2.Complementarity of SOMAscan to LC-MS/MS and RNA-seq for quantitative profiling of human embryonic and mesenchymal stem cells

关键词：ESC ; embryonic stem cells ; ESC-MSC ; embryonic stem cell-derived mesenchymal stem cells ; BM-MSC ; bone marrow-derived mesenchymal stem cells ; SOMA ; SOMAscan assay ; a trademark by SomaLogic ; Boulder CO ; RNA ; RNA sequencing ; PROT ; liquid chromatography coupled to mass spectrometry-based proteomics ; SDEs ; significant differentially expressed

刊名：Journal of Proteomics

出版年：2017

3.A male and female RNA marker to infer sex in forensic analysis

作者：M. van den Berge ^{m.van.den.berge@nfi.minvenj.nl} ; T. Sijen ; ^{t.sijen@nfi.minvenj.nl}

关键词：Forensic science ; mRNA profiling ; Body fluid identification ; Organ tissue identification ; Sex-specific RNA marker ; Sex-biased genes

刊名：Forensic Science International: Genetics

出版年：2017

4.RNAseq profiling of primary microglia and astrocyte cultures in near-term ovine fetus: A glial in vivo-in vitro multi-hit paradigm in large mammalian brain

作者：M. Cortes^a ; ¹ ; M. Cao^b ; ¹ ; H.L. Liu^b ; P. Burns^d ; C. Moore^c ; G. Fecteau^d ; A. Desrochers^d ; L.B. Barreiro^e ; J.P. Antel^c ; M.G. Frasch^a ; ^b ; ^{mfrasch@uw.edu}

关键词：Fetus ; Brain ; Microglia ; Astrocytes ; LPS ; in vitro ; in vivo ; Primary culture ; RNAseq

刊名：Journal of Neuroscience Methods

出版年：2017

5.LIN41 Post-transcriptionally Silences mRNAs by Two Distinct and Position-Dependent Mechanisms

作者：Florian Aeschimann¹ ; ² ; Pooja Kumari¹ ; Hrishikesh Bartake¹ ; ² ; Dimos Gaidatzis¹ ; ³ ; Lan Xu¹ ; Rafal Ciosk¹ ; Helge Groß ; hans¹ ; ⁴ ; ^{helge.grosshans@fmi.ch}

关键词：heterochronic ; EGR ; RNA-binding protein ; stem cell ; translational repression ; mRNA degradation ; 3&prime ; UTR ; 5&prime ; UTR ; ribosome profiling ; positional effect

刊名：Molecular Cell

出版年：2017

6.Utility of Systematic Isolation of immune cell subsets from HIV-infected individuals for miRNA profiling

作者：Manel E. Bargalló ; ^a ; ¹ ; Alberto C. Guardo^a ; ¹ ; Maria J. Maleno^a ; Laia Miralles^a ; Lander Egañ ; a-Gorroñ ; o^a ; ² ; Tuixent Escribà ; ^a ; Felipe Garcí ; a^b ; Jose M. Gatell^b ; Mireia Arnedo^a ; Montserrat Plana^a ; ^{MPLANA@clinic.cat} ;

关键词：HIV ; + populations ; Immunomagnetic separation ; RIN (RNA integrity number) ; Flow cytometry ; Immune response

刊名：Journal of Immunological Methods

出版年：2017

7.Next-generation sequencing-based small RNA profiling of cerebrospinal fluid exosomes

作者：Yohsuke Yagi^a ; ^b ; ¹ ; Takuya Ohkubo^a ; ^b ; ¹ ; Hideya Kawaji^c ; ^d ; ^e ; ^f ; ¹ ; Akira Machida^a ; ^b ; Haruka Miyata^a ; ^b ; Saori Goda^f ; Sugata Roy^d ; ^f ; Yoshihide Hayashizaki^c ; ^f ; Harukazu Suzuki^d ; ^f ; Takanori Yokota^a ; ^b ; ^{tak-yokota.nuro@tmd.ac.jp}

关键词：CI ; confidence interval ; CPM ; counts per million ; CSF ; cerebrospinal fluid ; dPCR ; digital PCR ; HDL ; high-density lipoprotein ; NGS ; next-generation sequencing

刊名：Neuroscience Letters

出版年：2017

8.Expression profiling of Bombyx mori gloverin2 gene and its synergistic antifungal effect with cecropin A against Beauveria bassiana

作者：Dingding Lü ; ^a ; ^b ; ^c ; Tao Geng^a ; ^b ; Chengxiang Hou^a ; ^b ; Guangxing Qin^a ; ^b ; Kun Gao^a ; ^b ; Xijie Guo^a ; ^b ; ^{guoxijie@126.com}

关键词：AMPs ; antimicrobial peptides ; BbHN6 ; Beauveria bassiana HN6 ; Bmgloverin2 ; Bombyx mori gloverin2 ; Gloverin ; Glv ; BmCecA ; Bombyx mori cecropin A ; RNA ; ribonucleic acid ; DNA ; deoxyribonucleic acid ; cDNA ; complementary deoxyribonucleic acid ; IPTG ; isopropyl β-d-thiogalactoside ; OD ; optical density ; SDS-PAGE ; sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis ; hpi ; hours post-inoculation ; LT50 ; the median lethal time ; PBS ; phosphate buffered saline ; PDA ; potato dextrose agar ; LB ; Luria&ndashB

刊名：Gene

出版年：2017

9.Simultaneous Transcriptional and Epigenomic Profiling from Specific Cell Types within Heterogeneous Tissues In Vivo

作者：Hyun Cheol Roh¹ ; Linus T.-Y. Tsai¹ ; Anna Lyubetskaya¹ ; Danielle Tenen¹ ; Manju Kumari¹ ; Evan D. Rosen¹ ; ² ; ³ ; ⁴ ; ^{erosen@bidmc.harvard.edu}

关键词：epigenomics ; ChIP-seq ; RNA-seq ; NuTRAP ; adipocyte

刊名：Cell Reports

出版年：2017

10.Gene expression profiling of bovine ovarian follicular and luteal cells provides insight into cellular identities and functions

作者：Sarah M. Romereim^a ; Adam F. Summers^a ; ¹ ; ^{asummers@nmsu.edu} ; William E. Pohlmeier^a ; Pan Zhang^b ; Xiaoying Hou^b ; Heather A. Talbott^b ; Robert A. Cushman^c ; ^{bob.cushman@ars.usda.gov} ; Jennifer R. Wood^a ; John S. Davis^b ; ^d ; ^{jsdavis@unmc.edu} ; Andrea S. Cupp^a ; ^{Acupp2@unl.edu}

关键词：Bovine ; Ovary ; Follicle ; Corpus luteum ; Transcriptome ; Cell identity

刊名：Molecular and Cellular Endocrinology

出版年：2017

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