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1.Pathway analysis of complex diseases for GWAS, extending to consider rare variants, multi-omics and interactions

作者：Patrick Y.P. Kao^a ; Kim Hung Leung^b ; Lawrence W.C. Chan^b ; Shea Ping Yip^b ; ^{shea.ping.yip@polyu.edu.hk} ; Maurice K.H. Yap^a

关键词：ARTP ; adaptive rank truncated product ; BMI ; body mass index ; (r)BEE ; (robust) brain-expressed enhancer ; CNV ; copy number variation ; eQTL ; expression quantitative trait locus ; ESI-MS/MS ; electrospray ionization mass spectrometry ; eSNP ; expression single-nucleotide polymorphism ; GCN ; gene coexpression network ; G-E ; gene-environment ; G-G ; gene-gene ; GEWIS ; genome-wide interaction study ; GO ; gene ontology ; GRN ; gene regulatory network ; GSAA ; gene set association analysis ; GSEA ; gene set enrichment a

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

出版年：2017

2.Multi-omics approach to study global changes in a triclosan-resistant mutant strain of Acinetobacter baumannii ATCC 17978

作者：Dinesh M. Fernando^a ; Patrick Chong^b ; Manu Singh^a ; Victor Spicer^c ; Mark Unger^a ; Peter C. Loewen^a ; Garrett Westmacott^b ; Ayush Kumar^a ; ^d ; ^{Ayush.Kumar@umanitoba.ca}

关键词：Genomics ; RNA-Seq ; Proteomics ; Global gene response

刊名：International Journal of Antimicrobial Agents

出版年：2017

3.A multi-omic approach to elucidate low-dose effects of xenobiotics in zebrafish (Danio rerio) larvae

作者：Susie S.Y. Huang^a ; ^b ; ^{shuang@axys.com} ; Jonathan P. Benskin^c ; Nik Veldhoen^b ; Bharat Chandramouli^a ; Heather Butler^a ; Caren C. Helbing^b ; John R. Cosgrove^a

关键词：Metabolomics ; Transcriptomics ; Systems biology ; Zebrafish ; Sublethal exposure ; Alternative animal model

刊名：Aquatic Toxicology

出版年：2017

4.Impact and influence of “omics” technology on hyper tension studies

作者：Alzenira Costa^a ; Octavio Luiz Franco^a ; ^b ; ^{ocfranco@gmail.com}

关键词：Hypertension ; Blood pressure ; Genomics ; Proteomics ; NGS

刊名：International Journal of Cardiology

出版年：2017

5.Systematic Characterization and Analysis of the Taxonomic Drivers of Functional Shifts in the Human Microbiome

作者：Ohad Manor¹ ; Elhanan Borenstein¹ ; ² ; ³ ; ⁴ ; ^elbo@uw.edu

关键词：human microbiome ; functional metagenomics ; taxonomic profiling ; compositional shifts ; comparative analysis ; microbial drivers ; multi-omics ; integrative analysis

刊名：Cell Host & Microbe

出版年：2017

6.Metabolism-Centric Trans-Omics

作者：Katsuyuki Yugi¹ ; ² ; ³ ; ^{katsuyuki.yugi@riken.jp} ; Shinya Kuroda³ ; ⁴ ; ^{skuroda@bs.s.u-tokyo.ac.jp}

刊名：Cell Systems

出版年：2017

7.Expanding the role of reactive transport models in critical zone processes

作者：Li Li^a ; ^{lili@engr.psu.edu} ; Kate Maher^b ; Alexis Navarre-Sitchler^c ; Jenny Druhan^d ; Christof Meile^e ; Corey Lawrence^f ; Joel Moore^g ; Julia Perdrial^h ; Pamela Sullivanⁱ ; Aaron Thompson^j ; Lixin Jin^k ; Edward W. Bolton^l ; Susan L. Brantley^m ; William E. Dietrichⁿ ; K. Ulrich Mayer^o ; Carl I. Steefel^p ; Albert Valocchi^q ; John Zachara^r ; Benjamin Kocar^s ; Jennifer Mcintosh^t ; Benjamin M. Tutolo^u ; Mukesh Kumar^v ; Eric Sonnenthal^p ; Chen Bao^a ; Joe Beisman^c

关键词：Critical Zone Processes ; Reactive transport models ; Chemical weathering ; Hydrological cycles ; Biogeochemical processes ; Spatial heterogeneity ; Root zone ; Isotopes

刊名：Earth-Science Reviews

出版年：2017

8.Transcriptome inference and systems approaches to polypharmacology and drug discovery in herbal medicine

作者：Peng Li^a ; ^{lipengcuc@163.com} ; Jianxin Chen^b ; Wuxia Zhang^a ; Bangze Fu^b ; Wei Wang^b ; ^{wangwei@bucm.edu.cn}

关键词：Herbal medicine ; Polypharmacological effects ; RNA-seq ; Transcriptome-based inference method ; Target identification

刊名：Journal of Ethnopharmacology

出版年：2017

9.Metabolic engineering of Bacillus subtilis fueled by systems biology: Recent advances and future directions

作者：Yanfeng Liu^a ; ^b ; Jianghua Li^a ; ^b ; Guocheng Du^a ; ^b ; Jian Chen^a ; ^b ; Long Liu^a ; ^b ; ^{longliu@jiangnan.edu.cn}

关键词：Systems biology ; Metabolic engineering ; Bacillus subtilis ; Global metabolism optimization

刊名：Biotechnology Advances

出版年：2017

10.Actinobacteria: Current research and perspectives for bioremediation of pesticides and heavy metals

关键词：Actinobacteria ; Bioremediation ; Pesticides ; Heavy metals ; Environmental pollution ; Co-contamination

刊名：Chemosphere

出版年：2017

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