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1.Understanding the progression of atherosclerosis through gene profiling and co-expression network analysis in Apob^tm2SgyLdlr^tm1Her double knockout mice

作者：Vrushali Deshpande^a ; Ankit Sharma^b ; Rupak Mukhopadhyay^c ; Lakshmi Narasimha Rao Thota^b ; Madankumar Ghatge^b ; Rajani Kanth Vangala^d ; Vijay V. Kakkar^e ; ^f ; Lakshmi Mundkur^a ; ^{lakshmi.mundkur@triindia.org.in" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：GCNA ; gene co-expression network analysis ; WGCNA ; weighted GCN analysis ; TOM ; topological overlap matrix ; LDL ; low density lipoprotein ; Ox-LDL ; oxidized low density lipoprotein ; MMP ; matrix metalloproteinases ; TNF ; tumor necrosis factor ; HIF-1 ; hypoxia inducing factor ; RT-qPCR ; quantitative reverse transcription PCR ; STC2 ; stanniocalcin 2 ; LEPR ; leptin receptor ; TM9SF1 ; transmembrane 9 superfamily member 1 ; WIF1 ; Wnt inhibitory factor 1 ; XLR5C ; X-linked lymphocyte-regulated 5C ; RAB11FIP3 ; Rab11

刊名：Genomics

出版年：2016

2.Population-specific renal proteomes of marine and freshwater three-spined sticklebacks

作者：Dietmar Kü ; ltz^a ; ^{dkueltz@ucdavis.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Johnathon Li^a ; Darlene Paguio^a ; Tuan Pham^a ; Marius Eidsaa^b ; Eivind Almaas^b

关键词：AC ; UniProt accession number ; BPC ; Base peak chromatogram ; CARD ; Caspase activation and recruitment domain ; DIA ; Data-independent acquisition ; FW ; Freshwater ; ID ; Identification ; LFQ ; Label-free quantitation ; Nt-Ac ; N-terminal acetylation ; PDI ; Protein disulfide isomerase ; P-Hox ; Proline hydroxylation ; SW ; Seawater ; Rt ; Retention time ; TMAO ; Trimethylamine oxide ; wTO ; Weighted topological overlap

刊名：Journal of Proteomics

出版年：2016

3.On the demultiplexing of chromosome capture conformation data

作者：Ivan Junier^a ; ^b ; ^c ; ^{ivan.junier@ujf-grenoble.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Yannick G. Spill^b ; ^d ; Marc A. Marti-Renom^b ; ^d ; Miguel Beato^b ; ^c ; Franç ; ois le Dily^b ; ^c

关键词：Genomic contact maps ; Demultiplexing ; Deconvolution ; Restrained-based methods ; Polymer models of chromosomes

刊名：FEBS Letters

出版年：2015

4.A lattice Dirac operator for QCD with light dynamical quarks

作者：Nigel Cundy^a ; ^c ; ^{ndcundy@phya.snu.ac.kr} ; A.D. Kennedy^b ; Andreas Schä ; fer^a

关键词：Chiral fermions ; Lattice QCD

刊名：Nuclear Physics B

出版年：2011

5.Trophic field overlap: A new approach to quantify keystone species

作者：Ferenc Jordán ; Wei-chung Liu ; Á ; gnes Mike

关键词：Ecological network ; Indirect effects ; Keystone species ; Trophic field ; Redundancy ; Centrality index ; Kuosheng Bay ; Taiwan ; ECEM 07

刊名：Ecological Modelling

出版年：2009

6.Light-mesh — A pragmatic optical access network architecture for IP-centric service oriented communication

作者：Ashwin Gumaste ; Deepak Diwakar ; Anuj Agrawal ; Akhil Lodha ; Nasir Ghani

关键词：PON ; Light-trail ; Light-frame Ethernet in optical access

刊名：Optical Switching and Networking

出版年：2008

7.The negativity of the overlap-based topological charge density correlator in pure-glue QCD and the non-integrable nature of its contact part

作者：Horv??th ; I. ; Alexandru ; A. ; Zhang ; J.B. ; Chen ; Y. ; Dong ; S.J. ; Draper ; T. ; Liu ; K.F. ; Mathur ; N. ; et. al.

刊名：Physics Letters B

出版年：2005

8.Overlap hypercube fermions in QCD simulations near the chiral limit

作者：Wolfgang Bietenholz and Stanislav Shcheredin

刊名：Nuclear Physics B

出版年：2006

9.Random matrix theory and the spectra of overlap fermions

作者：Shcheredin ; S. ; Bietenholz ; W. ; Chiarappa ; T. ; Jansen ; K. ; Nagai ; K.-I.

刊名：Nuclear Physics B - Proceedings Supplements

出版年：2004

10.Quark spectra and light hadron phenomenology from overlap fermions with improved gauge field action

作者：Galletly ; D. ; Gü ; rtler ; M. ; Horsley ; R. ; Joó ; B. ; Kennedy ; A.D. ; Perlt ; H. ; Pendleton ; B.J. ; et. al.

刊名：Nuclear Physics B - Proceedings Supplements

出版年：2004

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