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1.Transcriptional Regulatory Network of Plant Heat Stress Response

作者：Naohiko Ohama¹ ; ^&dagger ; ; Hikaru Sato² ; ^&dagger ; ; Kazuo Shinozaki² ; Kazuko Yamaguchi-Shinozaki¹ ; ^{akys@mail.ecc.u-tokyo.ac.jp}

关键词：heat stress ; transcription factor ; transcriptional regulatory network ; posttranslational regulation ; epigenetic regulation ; stress memory

刊名：Trends in Plant Science

出版年：2017

2.Computational inference of gene regulatory networks: Approaches, limitations and opportunities

作者：Michael Banf ; ^{michael.banf@gmx.net} ; Seung Y. Rhee ; ^{srhee@carnegiescience.edu}

关键词：Computational systems biology ; Gene regulatory network inference ; Machine learning ; Heterogeneous data integration ; Gene network evaluation

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

3.Highly Signal-Responsive Gene Regulatory Network Governing Myxococcus Development

作者：Lee Kroos¹ ; ^{kroos@msu.edu}

关键词：gene regulatory network ; signal transduction ; bacterial development ; sporulation ; Myxococcus xanthus

刊名：Trends in Genetics

出版年：2017

4.Transcriptional and post-transcriptional control of the plant circadian gene regulatory network

作者：C. Esteban Hernando¹ ; ^{chernando@leloir.org.ar} ; André ; s Romanowski¹ ; ^{aromanowski@leloir.org.ar} ; Marcelo J. Yanovsky ; ^{myanovsky@leloir.org.ar}

关键词：TTFL ; transcriptional-translational feedback loop ; HT-Y1H ; high-throughput yeast one hybrid ; ChIP ; chromatin immunoprecipitation ; AS ; alternative splicing

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

5.MicroRNA mediated network motifs in autoimmune diseases and its crosstalk between genes, functions and pathways

作者：Archana Prabahar ^{archana.prabahar@gmail.com} ; Jeyakumar Natarajan ; ^{n.jeyakumar@yahoo.co.in}

关键词：Autoimmune diseases ; Network motifs ; Immune signaling pathways ; Crosstalk ; microRNA

刊名：Journal of Immunological Methods

出版年：2017

6.A matter of time — How transient transcription factor interactions create dynamic gene regulatory networks

作者：Joseph Swift ; ^{jas1310@nyu.edu} ; Gloria M. Coruzzi

关键词：Transcription factor ; Transcription dynamics ; Transient DNA binding ; Plant genomics ; Epigenetics

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

7.Gene-regulatory networks controlling inflorescence and flower development in Arabidopsis thaliana

作者：Christopher Ralf Wils ; Kerstin Kaufmann ; ^{kerstin.kaufmann@uni-potsdam.de}

关键词：TF ; transcription factor ; MADS ; MCM1 ; AGAMOUS ; DEFICIENS ; SRF ; SEP ; SEPALLATA ; ChIP-seq ; chromatin immunoprecipitation followed by deep sequencing ; PcG ; Polycomb group ; H3K27me3 ; histone 3 lysine 27 tri-methylation ; PRC ; polycomb repressive complex ; trxG ; trithorax group ; SAND domain ; Sp100 ; AIRE-1 ; NucP41/75 ; DEAF-1 domain ; ULT ; ULTRAPETALA ; miRNA ; microRNA ; AP2 ; APETALA2 ; FLC ; FLOWERING LOCUS C ; SOC1 ; SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS1 ; FT ; FLOWERING LOCUS T ; FD ; FLOWERING LOCUS D ; IM

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

8.A Knockout Screen of ApiAP2 Genes Reveals Networks of Interacting Transcriptional Regulators Controlling the Plasmodium Life Cycle

作者：Katarzyna Modrzynska¹ ; ² ; ⁴ ; ^{km8@sanger.ac.uk} ; Claudia Pfander¹ ; Lia Chappell¹ ; Lu Yu¹ ; Catherine Suarez¹ ; ³ ; Kirsten Dundas¹ ; Ana Rita Gomes¹ ; David Goulding¹ ; Julian C. Rayner¹ ; Jyoti Choudhary¹ ; Oliver Billker¹ ; ^{ob4@sanger.ac.uk}

关键词：ap2-o ; ap2-o2 ; ap2-o3 ; ap2-o4 ; ap2-sp ; ap2-sp2 ; ap2-sp3 ; ap2-l ; Apetala 2 ; oocyst

刊名：Cell Host & Microbe

出版年：2017

9.Plant responses to abiotic stress: The chromatin context of transcriptional regulation

作者：Marí ; a-Amparo Asensi-Fabado ; Anna Amtmann ; Giorgio Perrella ; ^{Giorgio.Perrella@glasgow.ac.uk}

关键词：Co-expression ; Functional genomics ; Agriculture ; Crops ; Network analysis ; Guilt-by-association

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

10.A Fully Synthetic Transcriptional Platform for a Multicellular Eukaryote

作者：Justin Crocker¹ ; ² ; ^{crockerj@janelia.hhmi.org} ; Albert Tsai¹ ; David L. Stern¹

关键词：synthetic biology ; Drosophila ; regulatory networks ; enhancer ; transcription

刊名：Cell Reports

出版年：2017

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