作者：Chyi-Ying A. Chen¹ ; Ann-Bin Shyu¹ ; ^{Ann-Bin.Shyu@uth.tmc.edu}

关键词：alternative polyadenylation ; codon optimality ; m6A ; mRNA turnover ; transcriptome reprogramming

刊名：Trends in Biochemical Sciences

出版年：2017

作者：Teija Ojala^a ; ¹ ; ^{teija.ojala@helsinki.fi} ; Pia K.S. Laine^a ; Terhi Ahlroos^b ; Jarna Tanskanen^b ; Saara Pitkä ; nen^b ; Tuomas Salusjä ; rvi^b ; Matti Kankainen^b ; ² ; Soile Tynkkynen^b ; Lars Paulin^a ; Petri Auvinen^a

关键词：Cas ; CRISPR-associated protein ; CDS ; coding sequence ; COG ; clusters of orthologous groups ; CRISPR ; clustered regularly interspaced short palindromic repeats ; EMPP ; Embden-Meyerhof-Parnas-pathway ; FDR ; false discovery rate ; GI ; genomic island ; HGT ; horizontal gene transfer ; LAB ; lactic acid bacteria ; TCA ; tricarboxylic acid cycle ; TU ; transcription unit

刊名：International Journal of Food Microbiology

出版年：2017

作者：Alvaro Muñ ; oz-Ló ; pez¹ ; ² ; ¹⁶ ; Damià ; Romero-Moya¹ ; ² ; ¹⁶ ; Cristina Prieto¹ ; ² ; Veró ; nica Ramos-Mejí ; a³ ; Antonio Agraz-Doblas¹ ; ² ; ⁴ ; Ignacio Varela⁴ ; Marcus Buschbeck¹ ; Anna Palau¹ ; Xonia Carvajal-Vergara⁵ ; Alessandra Giorgetti¹ ; Anthony Ford⁶ ; Majlinda Lako⁷ ; Isabel Granada¹ ; ⁸ ; Neus Ruiz-Xivillé ; ¹ ; ⁸ ; Sandra Rodrí ; guez-Perales⁹ ; Raul Torres-Ruí ; z¹ ; ⁹ ; Ronald W. Stam¹⁰ ; Jose Luis Fuster¹¹ ; Mario F. Fraga¹² ; Mahito Nakanishi¹³ ; Gianni Cazzaniga¹⁴ ; Michela Bardini¹⁴ ; Isabel Cobo¹ ; ¹² ; Gustavo F. Bayon¹² ; Agustin F. Fernandez¹² ; Clara Bueno¹ ; ² ; ^{cbueno@carrerasresearch.org" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Pablo Menendez¹ ; ² ; ¹⁵ ; ^{pmenendez@carrerasresearch.org" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：iPSC ; cancer reprogramming ; MLL-AF4 ; B-ALL ; Sendai virus ; transcriptome ; DNA methylome

刊名：Stem Cell Reports

出版年：2016

作者：A. Koliopoulou¹ ; M.T. Rondina² ; H. Javan² ; S. Men² ; S.G. Drakos³ ; J. Stehlik³ ; S.H. McKellar¹ ; A.S. Weyrich² ; C.H. Selzman¹

刊名：Journal of Heart and Lung Transplantation

出版年：2016

作者：Alice Trivellini^a ; ^{alice.trivellini@gmail.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Mariella Lucchesini^b ; Antonio Ferrante^c ; Giulia Carmassi^b ; Guido Scatena^a ; Paolo Vernieri^b ; Anna Mensuali-Sodi^a

关键词：Antirrhinum majus L. ; NaCl stress ; RNAseq ; Transcriptome ; ABA ; Ethylene ; Snapdragon ; Ca2+ signaling ; Cell cycle progression

刊名：Environmental and Experimental Botany

出版年：2016

作者：Min Woo Lee^a ; ^d ; ¹ ; Rira Seo^b ; ¹ ; Yu Jeong Lee^b ; ¹ ; Ju Hye Bae^b ; ¹ ; Jung-Kwon Park^b ; Joung-Hahn Yoon^c ; Jei Wan Lee^d ; Ho Won Jung^a ; ^b ; ^{hwjung@dau.ac.kr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：ALTERED MERISTEM PROGRAM1 ; Arabidopsis thaliana ; Heat stress ; Pseudomonas syringae ; Transcriptome

刊名：Biochemical and Biophysical Research Communications

出版年：2016

作者：Nik Veldhoen ; Mitchel R. Stevenson ; Caren C. Helbing ; ^{chelbing@uvic.ca" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：cat ; catalase ; cebp1 ; CCAAT/enhancer binding protein 1 ; cirbp ; cold-inducible RNA binding protein ; hsp30 ; heat shock protein 30 ; klf9 ; Krü ; ppel-like factor 9 ; qPCR ; quantitative real-time polymerase chain reaction ; sod ; Cu/Zn superoxide dismutase ; T3 ; 3 ; 3&prime ; 5-triiodothyronine ; thra ; thyroid hormone receptor alpha ; thrb ; thyroid hormone receptor beta ; TH ; thyroid hormone ; thibz ; thyroid hormone-induced bZip protein ; TMS ; tricaine methane sulfonate

刊名：Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics

出版年：2015

作者：Jia Xue ; Susanne聽V. Schmidt ; Jil S ; er ; Astrid Draffehn ; Wolfgang Krebs ; Inga Quester ; Dominic De聽Nardo ; Trupti聽D. Gohel ; Martina Emde ; Lisa Schmidleithner ; Hariharasudan Ganesan ; Andrea Nino-Castro ; Michael聽R. Mallmann ; Larisa Labzin ; Heidi Theis ; Michael Kraut ; Marc Beyer ; Eicke Latz ; Tom聽C. Freeman ; Thomas Ulas ; Joachim聽L. Schultze ; et al.

刊名：Immunity

出版年：20 February, 2014

作者：Jai-Yoon Sul¹ ; Tae Kyung Kim¹ ; Jae Hee Lee¹ ; James Eberwine¹ ; ² ; ^{eberwine@upenn.edu}

关键词：RNA-mediated ; transdifferentiation ; TIPeR ; transcriptome transfer ; RNA ; cellular reprogramming

刊名：Trends in Biotechnology

出版年：2012

作者：Markus M.M. Bisschops^a ; ^b ; Priscilla Zwartjens^a ; ^b ; Sebastiaan G.F. Keuter^a ; ^b ; Jack T. Pronk^a ; ^b ; Pascale Daran-Lapujade^a ; ^b ; ^{p.a.s.daran-lapujade@tudelft.nl" class="auth_mail}

关键词：CFU ; colony forming units ; EDGE ; empirical analysis of digital gene expression data in R v 1.1.291 ; MIPS ; Munich Information Centre for Protein Sequences ; PDS ; post-diauxic shift ; PHO ; Pho80&ndash ; Pho85 kinase ; PKA ; cAMP-dependent protein kinase ; qs ; specific glucose uptake rate ; SAM ; significance analysis of microarrays v 4.0 ; STRE ; stress response element ; TOR ; target of rapamycin

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA)/Molecular Cell Research

出版年：May, 2014