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1. Global transcriptome analysis reveals extensive gene remodeling, alternative splicing and differential transcription profiles in non-seed vascular plant Selaginella moellendorffii

作者： Yan Zhu ; Longxian Chen ; Chengjun Zhang ; Pei Hao ; Xinyun Jing ; Xuan Li

关键词：S. moellendorffii ; Lycophyte ; Vascular plant ; Transcriptome ; Long noncoding RNA ; Alternative splicing ; Regulation ; Transcription

刊名：BMC Genomics

出版年：2017

2. Transcriptome analysis reveals critical genes and key pathways involved in early phyllotaxy development in maize

作者： Xiaojian Peng ; Wenbo Chai ; Yingquan Tan ; Qing Dong ; Haiyang Jiang…

关键词：Zea mays ; Phyllotaxy ; Differential gene expression ; Alternative splicing ; Transcriptome

刊名：Genes & Genomics

出版年：2017

3. SUMOylation regulates the intracellular fate of ZO-2

作者： Franziska Wetzel ; Sonnhild Mittag…

关键词：Tight junction ; Zonula occludens2β ; Catenin ; Glycogen ; synthase ; kinase ; 3β ; Occludin

刊名：Cellular and Molecular Life Sciences

出版年：2017

4. Phosphoproteomics of colon cancer metastasis: comparative mass spectrometric analysis of the isogenic primary and metastatic cell lines SW480 and SW620

作者： Alissa J. Schunter ; Xiaoshan Yue…

关键词：Colon cancer progression ; Phosphosite stoichiometry ; Immunoprecipitation–selected reaction monitoring ; Messenger RNA translation ; Immobilized metal affinity chromatography ; TiO2

刊名：Analytical and Bioanalytical Chemistry

出版年：2017

5. Transcriptome Sequencing to Identify Transcription Factor Regulatory Network and Alternative Splicing in Endothelial Cells Under VEGF Stimulation

作者： Fang Liu ; Xianxin Gao ; Jing Wang ; Chao Gao ; Xiaolin Li…

关键词：Alternative splicing ; Differentially expressed genes ; Human umbilical vein vascular endothelial cells ; Transcriptome sequencing ; Vascular endothelial growth factor

刊名：Journal of Molecular Neuroscience

出版年：2016

6. Isoform prefiltering improves performance of count-based methods for analysis of differential transcript usage

作者： Charlotte Soneson ; Katarina L. Matthes ; Malgorzata Nowicka…

关键词：RNA ; seq ; Differential Splicing ; Comparison

刊名：Genome Biology

出版年：2016

7. YT521 promotes metastases of endometrial cancer by differential splicing of vascular endothelial growth factor A

作者： Bo Zhang ; Xiaowen Shao ; Jianhong Zhou ; Jin Qiu ; Yi Wu ; Jiajing Cheng

关键词：Endometrial carcinoma ; Vascular endothelial growth factor A ; YT521 ; mRNA splicing

刊名：Tumor Biology

出版年：2016

8. Alternative splicing of inner-ear-expressed genes

作者： Yanfei Wang ; Yueyue Liu ; Hongyun Nie ; Xin Ma ; Zhigang Xu

关键词：alternative splicing ; inner ear ; hearing loss ; hair cells

刊名：Frontiers of Medicine

出版年：2016

9. Image Encryption Technology Based on Chaotic Hash Function and DNA Splicing Model

关键词：Chaotic system ; Hash function ; Splicing model ; Image encryption

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2016

10. Algorithms for differential splicing detection using exon arrays: a comparative assessment

作者：Karin Zimmermann (1)
Marcel Jentsch (2)
Axel Rasche (3)
Michael Hummel (4)
Ulf Leser (1)

1. Department of Computer Science ; Knowledge Management in Bioinformatics ; Humboldt Universitaet zu Berlin ; Rudower Chaussee 25 ; Berlin ; 12489 ; Germany
2. Department of Mathematics and Computer Science ; Freie Universitaet Berlin ; Berlin ; Germany
3. Department of Vertebrate Genomics ; Max Planck Institute for Molecular Genetics ; Ihnestr. 63-73 ; Berlin ; 14195 ; Germany
4. Institut fuer Pathologie CBF ; Charite - Universitaetsmedizin Berlin ; Hindenburgdamm 30 ; Berlin ; 12200 ; Germany

关键词：Alternative splicing ; Differential splicing ; Exon arrays ; Method comparison ; Parameter influence

刊名：BMC Genomics

出版年：2015

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