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1. Development of an integrated linkage map of einkorn wheat and its application for QTL mapping and genome sequence anchoring

作者： Kang Yu ; Dongcheng Liu ; Wenying Wu ; Wenlong Yang…

刊名：Theoretical and Applied Genetics

出版年：2017

2. MaGuS: a tool for quality assessment and scaffolding of genome assemblies with Whole Genome Profiling₿Data

作者： Mohammed-Amin Madoui ; Carole Dossat ; Léo d'Agata ; Jan van Oeveren…

关键词：Scaffolding ; Genome map ; Anchoring ; Whole genome profiling ; Arabidopsis

刊名：BMC Bioinformatics

出版年：2016

3. Anchoring genome sequence to chromosomes of the central bearded dragon (Pogona vitticeps) enables reconstruction of ancestral squamate macrochromosomes and identifies sequence content of the Z chromosome

作者： Janine E. Deakin ; Melanie J. Edwards ; Hardip Patel ; Denis O’Meally…

关键词：Cytogenetic map ; Genome evolution ; Ancestral karyotype ; Reptile ; Macrochromosome ; Microchromosome ; Sex chromosome ; Sex determination

刊名：BMC Genomics

出版年：2016

4. Anchoring the consensus ICuGI genetic map to the melon (Cucumis melo L.) genome

作者： Aurora Diaz ; Javier Forment ; Jason M. Argyris ; Nobuko Fukino…

关键词：Cucumis melo L. ; Simple sequence repeat ; Single nucleotide polymorphism ; Physical map ; Genome anchoring ; QTL

刊名：Molecular Breeding

出版年：2015

5. Construction of high resolution genetic linkage maps to improve the soybean genome sequence assembly Glyma1.01

作者： Qijian Song ; Jerry Jenkins ; Gaofeng Jia ; David L. Hyten ; Vince Pantalone…

关键词：Soybean ; Wm82.a2.v1 assembly ; BARCSOYSSR_1.0 database ; SoySNP50K BeadChip ; euchromatic and heterochromatic regions ; linkage map

刊名：BMC Genomics

出版年：2016

6. Genome analysis and avirulence gene cloning using a high-density RADseq linkage map of the flax rust fungus, Melampsora lini

作者： Claire Anderson ; Muhammad Adil Khan ; Ann-Maree Catanzariti ; Cameron A. Jack…

关键词：Avirulence gene ; Genetic linkage map ; Loss of heterozygosity (LOH) ; Map ; based cloning ; Melampsora lini ; Recombination ; Restriction ; site associated DNA sequencing (RADseq) ; Rust fungus ; Scaffold anchoring

刊名：BMC Genomics

出版年：2016

7. Use of targeted SNP selection for an improved anchoring of the melon (Cucumis melo L.) scaffold genome assembly

作者：Jason M Argyris (1)
Aurora Ruiz-Herrera (2) (3)
Pablo Madriz-Masis (1)
Walter Sanseverino (1) (5)
Jordi Morata (1)
Marta Pujol (1)
Sebasti谩n E Ramos-Onsins (4)
Jordi Garcia-Mas (1)

1. IRTA ; Centre for Research in Agricultural Genomics (CRAG) CSIC-IRTA-UAB-UB ; 08193 ; Barcelona ; Spain
2. Departament de Biologia Cellular ; Fisiologia i Immunologia ; Universitat Aut貌noma de Barcelona ; Campus UAB ; 08193 ; Barcelona ; Spain
3. Institut de Biotecnologia i Biomedicina (IBB) ; Universitat Aut貌noma de Barcelona ; Campus UAB ; 08193 ; Barcelona ; Spain
5. Present Address ; Sequentia Biotech ; Campus UAB - Edifici CRAG ; Bellaterra - Cerdanyola del Vall猫s ; 08193 ; Barcelona ; Spain
4. Centre for Research in Agricultural Genomics (CRAG) CSIC-IRTA-UAB-UB ; 08193 ; Barcelona ; Spain

关键词：Melon ; SNP ; Genome ; Scaffold ; Pseudomolecules ; FISH ; Karyotype

刊名：BMC Genomics

出版年：2015

8. A high-density genetic map for anchoring genome sequences and identifying QTLs associated with dwarf vine in pumpkin (Cucurbita maxima Duch.)

作者： Guoyu Zhang ; Yi Ren ; Honghe Sun ; Shaogui Guo ; Fan Zhang ; Jie Zhang…

关键词：High ; density genetic map ; Pumpkin (Cucurbita maxima Duch.) ; Scaffold anchoring ; QTL mapping ; Dwarf vine

刊名：BMC Genomics

出版年：2015

9. The application of GBS markers for extending the dense genetic map of rye (Secale cereale L.) and the localization of the Rfc1 gene restoring male fertility in plants with the C source of sterility-inducing cytoplasm

作者： Paweł Milczarski ; Monika Hanek ; Mirosław Tyrka…

关键词：Cytoplasmic male sterility (CMS) ; Genetic map ; Genotyping by sequencing (GBS) ; Rye

刊名：Journal of Applied Genetics

出版年：2016

10. Full-genome identification and characterization of NBS-encoding disease resistance genes in wheat

作者： Dhia Bouktila ; Yosra Khalfallah ; Yosra Habachi-Houimli…

关键词：Triticum aestivum ; NBS ; Resistance genes ; Biotic stress ; Genome analysis

刊名：Molecular Genetics and Genomics

出版年：2015

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