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1. The extremal spectral radii of \(k\) -uniform supertrees

作者： Honghai Li ; Jia-Yu Shao ; Liqun Qi

关键词：Hypergraph ; Spectral radius ; Adjacency tensor ; Signless Laplacian tensor ; Incidence \(Q\) ; tensor ; Supertree

刊名：Journal of Combinatorial Optimization

出版年：2016

2. Path-Difference Median Trees

关键词：Phylogenetic trees ; Median trees ; Supertrees ; Path ; difference distance ; Local search

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2016

3. Counting, Generating and Sampling Tree Alignments

关键词：Tree alignment ; RNA secondary structure ; Dynamic programming

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2016

4. FlipCut Supertrees: Towards Matrix Representation Accuracy in Polynomial Time

作者：Malte Brinkmeyer (1)
Thasso Griebel (1)
Sebastian B?cker (1)

关键词：Phylogenetics ; Supertrees ; Algorithms ; Minimum cut ; Perfect phylogeny ; Minimum flip supertree problem

刊名：Algorithmica

出版年：2013

5. L.U.St: a tool for approximated maximum likelihood supertree reconstruction

作者：Wasiu A Akanni (1) (2)
Christopher J Creevey (3)
Mark Wilkinson (2)
Davide Pisani (1) (4)

1. Department of Biology ; The National University of Ireland ; Maynooth ; Maynooth ; Kildare ; Ireland
2. Department of Life Sciences ; The Natural History Museum ; London ; SW7 5BD ; UK
3. Institute of Biological ; Environmental and Rural Sciences (IBERS) ; Aberystwyth University ; Aberystwyth ; Ceredigion ; SY23 3FG ; UK
4. School of Biological Sciences and School of Earth Sciences ; The University of Bristol ; Woodland Road ; BS8 1UG ; Bristol ; UK

关键词：Supertrees ; Maximum likelihood ; Phylogenomics ; Tests of two trees

刊名：BMC Bioinformatics

出版年：2014

6. Reconstructing a SuperGeneTree minimizing reconciliation

作者： Manuel Lafond ; Aïda Ouangraoua ; Nadia El-Mabrouk

关键词：Super gene tree ; Reconciliation ; Supertree

刊名：BMC Bioinformatics

出版年：2015

7. On Low Treewidth Graphs and Supertrees

作者：Alexander Grigoriev (20)
Steven Kelk (21)
Nela Leki? (21)

关键词：Phylogenetic tree ; unrooted compatibility ; supertree ; display graph ; treewidth

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2014

8. Characterizing compatibility and agreement of unrooted trees via cuts in graphs

作者： Sudheer Vakati ; David Fernández-Baca

关键词：Phylogenies ; Supertrees ; Compatibility ; Agreement ; Cuts in graphs ; Chordal graphs

刊名：Algorithms for Molecular Biology

出版年：2014

9.Algorithms for Knowledge-Enhanced Supertrees

作者：André Wehe (1)
J. Gordon Burleigh (2)
Oliver Eulenstein (1)

关键词：Evolutionary biology – supertree – Robinson ; Foulds

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2012

10.GTP Supertrees from Unrooted Gene Trees: Linear Time Algorithms for NNI Based Local Searches

作者：Pawe? Górecki (1) gorecki@mimuw.edu.pl
J. Gordon Burleigh (2) gburleigh@ufl.edu
Oliver Eulenstein (3) oeulenst@cs.iastate.edu

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2012

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