作者：Roadmap Epigenomics Consortium ; Anshul Kundaje ; Wouter Meuleman ; Jason Ernst ; Misha Bilenky ; Angela Yen ; Alireza Heravi-Moussavi ; Pouya Kheradpour ; Zhizhuo Zhang ; Jianrong Wang ; Michael J. Ziller ; Viren Amin ; John W. Whitaker ; Matthew D. Schultz ; Lucas D. Ward ; Abhishek Sarkar ; Gerald Quon ; Richard S. Sandstrom ; Matthew L. Eaton ; Yi-Chieh Wu ; Andreas R. Pfenning ; Xinchen Wang ; Melina Claussnitzer ; Yaping Liu ; Cristian Coarfa ; R. Alan Harris ; Noam Shoresh ; Charles B. Epstein ; Elizabeta Gjoneska ; Danny Leung ; Wei Xie ; R. David Hawkins ; Ryan Lister ; Chibo Hong ; Philippe Gascard ; Andrew J. Mungall ; Richard Moore ; Eric Chuah ; Angela Tam ; Theresa K. Canfield ; R. Scott Hansen ; Rajinder Kaul ; Peter J. Sabo ; Mukul S. Bansal ; Annaick Carles ; Jesse R. Dixon ; Kai-How Farh ; Soheil Feizi ; Rosa Karlic ; Ah-Ram Kim ; Ashwinikumar Kulkarni ; Daofeng Li ; Rebecca Lowdon ; GiNell Elliott ; Tim R. Mercer ; Shane J. Neph ; Vitor Onuchic ; Paz Polak ; Nisha Rajagopal ; Pradipta Ray ; Richard C. Sallari ; Kyle T. Siebenthall ; Nicholas A. Sinnott-Armstrong ; Michael Stevens ; Robert E. Thurman ; Jie Wu ; Bo Zhang ; Xin Zhou ; Arthur E. Beaudet ; Laurie A. Boyer ; Philip L. De Jager ; Peggy J. Farnham ; Susan J. Fisher ; David Haussler ; Steven J. M. Jones ; Wei Li ; Marco A. Marra ; Michael T. McManus ; Shamil Sunyaev ; James A. Thomson ; Thea D. Tlsty ; Li-Huei Tsai ; Wei Wang ; Robert A. Waterland ; Michael Q. Zhang ; Lisa H. Chadwick ; Bradley E. Bernstein ; Joseph F. Costello ; Joseph R. Ecker ; Martin Hirst ; Alexander Meissner ; Aleksandar Milosavljevic ; Bing Ren ; John A. Stamatoyannopoulos ; Ting Wang ; Manolis Kellis ; Roadmap Epigenomics Consortium

关键词：Epigenomics ; Data integration ; Regulatory networks ; Genome-wide association studies

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Frank M. J. Jacobs ; David Greenberg ; Ngan Nguyen ; Maximilian Haeussler ; Adam D. Ewing ; Sol Katzman ; Benedict Paten ; Sofie R. Salama ; David Haussler

关键词：Molecular evolution ; Transposition ; Evolutionary biology ; DNA transposable elements

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Olivier Delaneau ; Jonathan Marchini ; The 1000 Genomes Project Consortium ; Gil A. McVean ; Peter Donnelly ; Gerton Lunter ; Jonathan L. Marchini ; Simon Myers ; Anjali Gupta-Hinch ; Zamin Iqbal ; Iain Mathieson ; Andy Rimmer ; Dionysia K. Xifara ; Angeliki Kerasidou ; Claire Churchhouse ; Olivier Delaneau ; David M. Altshuler ; Stacey B. Gabriel ; Eric S. Lander ; Namrata Gupta ; < ; span class=' ; extra' ; > ; Mark J. Daly ; Mark A. DePristo ; Eric Banks ; Gaurav Bhatia ; Mauricio O. Carneiro ; Guillermo del Angel ; Giulio Genovese ; Robert E. Handsaker ; Chris Hart ; Steven A. McCarroll ; James C. Nemesh ; Ryan E. Poplin ; Stephen F. Schaffner ; Khalid Shakir ; Pardis C. Sabeti ; Sharon R. Grossman ; Shervin Tabrizi ; Ridhi Tariya ; Heng Li ; David Reich ; Richard M. Durbin ; Matthew E. Hurles ; Senduran Balasubramaniam ; John Burton ; Petr Danecek ; Thomas M. Keane ; Anja Kolb-Kokocinski ; Shane McCarthy ; James Stalker ; Michael Quail ; Qasim Ayub ; Yuan Chen ; Alison J. Coffey ; Vincenza Colonna ; Ni Huang ; Luke Jostins ; Aylwyn Scally ; Klaudia Walter ; Yali Xue ; Yujun Zhang ; Ben Blackburne ; Sarah J. Lindsay ; Zemin Ning ; Adam Frankish ; Jennifer Harrow ; Chris Tyler-Smith ; Gonalo R. Abecasis ; Hyun Min Kang ; Paul Anderson ; Tom Blackwell ; Fabio Busonero ; Christian Fuchsberger ; Goo Jun ; Andrea Maschio ; Eleonora Porcu ; Carlo Sidore ; Adrian Tan ; Mary Kate Trost ; David R. Bentley ; Russell Grocock ; Sean Humphray ; Terena James ; Zoya Kingsbury ; Markus Bauer ; R. Keira Cheetham ; Tony Cox ; Michael Eberle ; Lisa Murray ; Richard Shaw ; Aravinda Chakravarti ; Andrew G. Clark ; Alon Keinan ; Juan L. Rodriguez-Flores ; Francisco M. De La Vega ; Jeremiah Degenhardt ; Evan E. Eichler ; Paul Flicek ; Laura Clarke ; Rasko Leinonen ; Richard E. Smith ; Xiangqun Zheng-Bradley ; Kathryn Beal ; Fiona Cunningham ; Javier Herrero ; William M. McLaren ; Graham R. S. Ritchie ; Jonathan Barker ; Gavin Kelman ; Eugene Kulesha ; Rajesh Radhakrishnan ; Asier Roa ; Dmitriy Smirnov ; Ian Streeter ; Iliana Toneva ; Richard A. Gibbs ; Huyen Dinh ; Christie Kovar ; Sandra Lee ; Lora Lewis ; Donna Muzny ; Jeff Reid ; Min Wang ; Fuli Yu ; Matthew Bainbridge ; Danny Challis ; Uday S. Evani ; James Lu ; Uma Nagaswamy ; Aniko Sabo ; Yi Wang ; Jin Yu ; Gerald Fowler ; Walker Hale ; Divya Kalra ; Eric D. Green ; Bartha M. Knoppers ; Jan O. Korbel ; Tobias Rausch ; Adrian M. Sttz ; Charles Lee ; Lauren Griffin ; Chih-Heng Hsieh ; Ryan E. Mills ; Marcin von Grotthuss ; Chengsheng Zhang ; Xinghua Shi ; Hans Lehrach ; Ralf Sudbrak ; Vyacheslav S. Amstislavskiy ; Matthias Lienhard ; Florian Mertes ; Marc Sultan ; Bernd Timmermann ; Marie-Laure Yaspo ; Sudbrak ; Ralf Herwig ; Elaine R. Mardis ; Richard K. Wilson ; Lucinda Fulton ; Robert Fulton ; George M. Weinstock ; Asif Chinwalla ; Li Ding ; David Dooling ; Daniel C. Koboldt ; Michael D. McLellan ; John W. Wallis ; Michael C. Wendl ; Qunyuan Zhang ; Gabor T. Marth ; Erik P. Garrison ; Deniz Kural ; Wan-Ping Lee ; Wen Fung Leong ; Alistair N. Ward ; Jiantao Wu ; Mengyao Zhang ; Deborah A. Nickerson ; Can Alkan ; Fereydoun Hormozdiari ; Arthur Ko ; Peter H. Sudmant ; Jeanette P. Schmidt ; Christopher J. Davies ; Jeremy Gollub ; Teresa Webster ; Brant Wong ; Yiping Zhan ; Stephen T. Sherry ; Chunlin Xiao ; Deanna Church ; Victor Ananiev ; Zinaida Belaia ; Dimitriy Beloslyudtsev ; Nathan Bouk ; Chao Chen ; Robert Cohen ; Charles Cook ; John Garner ; Timothy Hefferon ; Mikhail Kimelman ; Chunlei Liu ; John Lopez ; Peter Meric ; Yuri Ostapchuk ; Lon Phan ; Sergiy Ponomarov ; Valerie Schneider ; Eugene Shekhtman ; Karl Sirotkin ; Douglas Slotta ; Hua Zhang ; Jun Wang ; Xiaodong Fang ; Xiaosen Guo ; Min Jian ; Hui Jiang ; Xin Jin ; Guoqing Li ; Jingxiang Li ; Yingrui Li ; Xiao Liu ; Yao Lu ; Xuedi Ma ; Shuaishuai Tai ; Meifang Tang ; Bo Wang ; Guangbiao Wang ; Honglong Wu ; Renhua Wu ; Ye Yin ; Wenwei Zhang ; Jiao Zhao ; Meiru Zhao ; Xiaole Zheng ; Lachlan J.M. Coin ; Lin Fang ; Qibin Li ; Zhenyu Li ; Haoxiang Lin ; Binghang Liu ; Ruibang Luo ; Haojing Shao ; Bingqiang Wang ; Yinlong Xie ; Chen Ye ; Chang Yu ; Hancheng Zheng ; Hongmei Zhu ; Hongyu Cai ; Hongzhi Cao ; Yeyang Su ; Zhongming Tian ; Huanming Yang ; Ling Yang ; Jiayong Zhu ; Zhiming Cai ; Jian Wang ; Marcus W. Albrecht ; Tatiana A. Borodina ; Adam Auton ; Seungtai C. Yoon ; Jayon Lihm ; Vladimir Makarov ; Hanjun Jin ; Wook Kim ; Ki Cheol Kim ; Srikanth Gottipati ; Danielle Jones ; David N. Cooper ; Edward V. Ball ; Peter D. Stenson ; Bret Barnes ; Scott Kahn ; Kai Ye ; Mark A. Batzer ; Miriam K. Konkel ; Jerilyn A. Walker ; Daniel G. MacArthur ; Monkol Lek ; Mark D. Shriver ; Carlos D. Bustamante ; Simon Gravel ; Eimear E. Kenny ; Jeffrey M. Kidd ; Phil Lacroute ; Brian K. Maples ; Andres Moreno-Estrada ; Fouad Zakharia ; Brenna Henn ; Karla Sandoval ; Jake K. Byrnes ; Eran Halperin ; Yael Baran ; David W. Craig ; Alexis Christoforides ; Tyler Izatt ; Ahmet A. Kurdoglu ; Shripad A. Sinari ; Nils Homer ; Kevin Squire ; Jonathan Sebat ; Vineet Bafna ; Kenny Ye ; Esteban G. Burchard ; Ryan D. Hernandez ; Christopher R. Gignoux ; David Haussler ; Sol J. Katzman ; W. James Kent ; Bryan Howie ; Andres Ruiz-Linares ; Emmanouil T. Dermitzakis ; Tuuli Lappalainen ; Scott E. Devine ; Xinyue Liu ; Ankit Maroo ; Luke J. Tallon ; Jeffrey A. Rosenfeld ; Leslie P. Michelson ; Andrea Angius ; Francesco Cucca ; Serena Sanna ; Abigail Bigham ; Chris Jones ; Fred Reinier ; Yun Li ; Robert Lyons ; David Schlessinger ; Philip Awadalla ; Alan Hodgkinson ; Taras K. Oleksyk ; Juan C. Martinez-Cruzado ; Yunxin Fu ; Xiaoming Liu ; Momiao Xiong ; Lynn Jorde ; David Witherspoon ; Jinchuan Xing ; Brian L. Browning ; Iman Hajirasouliha ; Ken Chen ; Cornelis A. Albers ; Mark B. Gerstein ; Alexej Abyzov ; Jieming Chen ; Yao Fu ; Lukas Habegger ; Arif O. Harmanci ; Xinmeng Jasmine Mu ; Cristina Sisu ; Suganthi Balasubramanian ; Mike Jin ; Ekta Khurana ; Declan Clarke ; Jacob J. Michaelson ; Chris OSullivan ; Kathleen C. Barnes ; Neda Gharani ; Lorraine H. Toji ; Norman Gerry ; Jane S. Kaye ; Alastair Kent ; Rasika Mathias ; Pilar N. Ossorio ; Michael Parker ; Charles N. Rotimi ; Charmaine D. Royal ; Sarah Tishkoff ; Marc Via ; Walter Bodmer ; Gabriel Bedoya ; Gao Yang ; Chu Jia You ; Andres Garcia-Montero ; Alberto Orfao ; Julie Dutil ; Lisa D. Brooks ; Adam L. Felsenfeld ; Jean E. McEwen ; Nicholas C. Clemm ; Mark S. Guyer ; Jane L. Peterson ; Audrey Duncanson ; Michael Dunn ; Leena Peltonenz

刊名：Nature Communications

出版年：2014

作者：Jessica Alfö ; ldi ; Federica Di Palma ; Manfred Grabherr ; Christina Williams ; Lesheng Kong ; Evan Mauceli ; Pamela Russell ; Craig B. Lowe ; Richard E. Glor ; Jacob D. Jaffe ; David A. Ray ; Stephane Boissinot ; Andrew M. Shedlock ; Christopher Botka ; Todd A. Castoe ; John K. Colbourne ; Matthew K. Fujita ; Ricardo Godinez Moreno ; Boudewijn F. ten Hallers ; David Haussler ; Andreas Heger ; David Heiman ; Daniel E. Janes ; Jeremy Johnson ; Pieter J. de Jong ; Maxim Y. Koriabine ; Marcia Lara ; Peter A. Novick ; Chris L. Organ ; Sally E. Peach ; Steven Poe ; David D. Pollock ; Kevin de Queiroz ; Thomas Sanger ; Steve Searle ; Jeremy D. Smith ; Zachary Smith ; Ross Swofford ; Jason Turner-Maier ; Juli Wade ; Sarah Young ; Amonida Zadissa ; Scott V. Edwards ; Travis C. Glenn ; Christopher J. Schneider ; Jonathan B. Losos ; Eric S. Lander ; Matthew Breen ; Chris P. Ponting ; Kerstin Lindblad-Toh

关键词：Genetics and genomics

刊名：Nature

出版年：2011

作者：Devin P. Locke ; LaDeana W. Hillier ; Wesley C. Warren ; Kim C. Worley ; Lynne V. Nazareth ; Donna M. Muzny ; Shiaw-Pyng Yang ; Zhengyuan Wang ; Asif T. Chinwalla ; Pat Minx ; Makedonka Mitreva ; Lisa Cook ; Kim D. Delehaunty ; Catrina Fronick ; Heather Schmidt ; Lucinda A. Fulton ; Robert S. Fulton ; Joanne O. Nelson ; Vincent Magrini ; Craig Pohl ; Tina A. Graves ; Chris Markovic ; Andy Cree ; Huyen H. Dinh ; Jennifer Hume ; Christie L. Kovar ; Gerald R. Fowler ; Gerton Lunter ; Stephen Meader ; Andreas Heger ; Chris P. Ponting ; Tomas Marques-Bonet ; Can Alkan ; Lin Chen ; Ze Cheng ; Jeffrey M. Kidd ; Evan E. Eichler ; Simon White ; Stephen Searle ; Albert J. Vilella ; Yuan Chen ; Paul Flicek ; Jian Ma ; Brian Raney ; Bernard Suh ; Richard Burhans ; Javier Herrero ; David Haussler ; Rui Faria ; Olga Fernando ; Fleur Darré ; Domè ; nec Farré ; Elodie Gazave ; Meritxell Oliva ; Arcadi Navarro ; Roberta Roberto ; Oronzo Capozzi ; Nicoletta Archidiacono ; Giuliano Della Valle ; Stefania Purgato ; Mariano Rocchi ; Miriam K. Konkel ; Jerilyn A. Walker ; Brygg Ullmer ; Mark A. Batzer ; Arian F. A. Smit ; Robert Hubley ; Claudio Casola ; Daniel R. Schrider ; Matthew W. Hahn ; Victor Quesada ; Xose S. Puente ; Gonzalo R. Ordoñ ; ez ; Carlos Ló ; pez-Otín ; Tomas Vinar ; Brona Brejova ; Aakrosh Ratan ; Robert S. Harris ; Webb Miller ; Carolin Kosiol ; Heather A. Lawson ; Vikas Taliwal ; André ; L. Martins ; Adam Siepel ; Arindam RoyChoudhury ; Xin Ma ; Jeremiah Degenhardt ; Carlos D. Bustamante ; Ryan N. Gutenkunst ; Thomas Mailund ; Julien Y. Dutheil ; Asger Hobolth ; Mikkel H. Schierup ; Oliver A. Ryder ; Yuko Yoshinaga ; Pieter J. de Jong ; George M. Weinstock ; Jeffrey Rogers ; Elaine R. Mardis ; Richard A. Gibbs ; Richard K. Wilson

关键词：Genetics and genomics ; Evolution ; Genetics and genomics ; Organismal biology

刊名：Nature

出版年：2011

作者：Kerstin Lindblad-Toh ; Manuel Garber ; Or Zuk ; Michael F. Lin ; Brian J. Parker ; Stefan Washietl ; Pouya Kheradpour ; Jason Ernst ; Gregory Jordan ; Evan Mauceli ; Lucas D. Ward ; Craig B. Lowe ; Alisha K. Holloway ; Michele Clamp ; Sante Gnerre ; Jessica Alfö ; ldi ; Kathryn Beal ; Jean Chang ; Hiram Clawson ; James Cuff ; Federica Di Palma ; Stephen Fitzgerald ; Paul Flicek ; Mitchell Guttman ; Melissa J. Hubisz ; David B. Jaffe ; Irwin Jungreis ; W. James Kent ; Dennis Kostka ; Marcia Lara ; Andre L. Martins ; Tim Massingham ; Ida Moltke ; Brian J. Raney ; Matthew D. Rasmussen ; Jim Robinson ; Alexander Stark ; Albert J. Vilella ; Jiayu Wen ; Xiaohui Xie ; Michael C. Zody ; Broad Institute Sequencing Platform and Whole Genome Assembly Team ; Kim C. Worley ; Christie L. Kovar ; Donna M. Muzny ; Richard A. Gibbs ; Baylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center Sequencing Team ; Wesley C. Warren ; Elaine R. Mardis ; George M. Weinstock ; Richard K. Wilson ; Genome Institute at Washington University ; Ewan Birney ; Elliott H. Margulies ; Javier Herrero ; Eric D. Green ; David Haussler ; Adam Siepel ; Nick Goldman ; Katherine S. Pollard ; Jakob S. Pedersen ; Eric S. Lander ; Manolis Kellis

关键词：Genetics and genomics ; Evolution ; Genetics and genomics ; Disease

刊名：Nature

出版年：2011

作者：Alika K. Maunakea ; Raman P. Nagarajan ; Mikhail Bilenky ; Tracy J. Ballinger ; Cletus D’Souza ; Shaun D. Fouse ; Brett E. Johnson ; Chibo Hong ; Cydney Nielsen ; Yongjun Zhao ; Gustavo Turecki ; Allen Delaney ; Richard Varhol ; Nina Thiessen ; Ksenya Shchors ; Vivi M. Heine ; David H. Rowitch ; Xiaoyun Xing ; Chris Fiore ; Maximiliaan Schillebeeckx ; Steven J. M. Jones ; David Haussler ; Marco A. Marra ; Martin Hirst ; Ting Wang ; Joseph F. Costello

关键词：Molecular biology ; Genomics ; Genetics

刊名：Nature

出版年：2010

作者：J. W. Thomas ; J. W. Touchman ; R. W. Blakesley ; G. G. Bouffard ; S. M. Beckstrom-Sternberg ; E. H. Margulies ; M. Blanchette ; A. C. Siepel ; P. J. Thomas ; J. C. McDowell ; B. Maskeri ; N. F. Hansen ; M. S. Schwartz ; R. J. Weber ; W. J. Kent ; D. Karolchik ; T. C. Bruen ; R. Bevan ; D. J. Cutler ; S. Schwartz ; L. Elnitski ; J. R. Idol ; A. B. Prasad ; S.-Q. Lee-Lin ; V. V. B. Maduro ; T. J. Summers ; M. E. Portnoy ; N. L. Dietrich ; N. Akhter ; K. Ayele ; B. Benjamin ; K. Cariaga ; C. P. Brinkley ; S. Y. Brooks ; S. Granite ; X. Guan ; J. Gupta ; P. Haghighi ; S.-L. Ho ; M. C. Huang ; E. Karlins ; P. L. Laric ; R. Legaspi ; M. J. Lim ; Q. L. Maduro ; C. A. Masiello ; S. D. Mastrian ; J. C. McCloskey ; R. Pearson ; S. Stantripop ; E. E. Tiongson ; J. T. Tran ; C. Tsurgeon ; J. L. Vogt ; M. A. Walker ; K. D. Wetherby ; L. S. Wiggins ; A. C. Young ; L.-H. Zhang ; K. Osoegawa ; B. Zhu ; B. Zhao ; C. L. Shu ; P. J. De Jong ; C. E. Lawrence ; A. F. Smit ; A. Chakravarti ; D. Haussler ; P. Green ; W. MillerandE. D. Green

刊名：Nature

出版年：2003

作者：Alexander Stark ; Michael F. Lin ; Pouya Kheradpour ; Jakob S. Pedersen ; Leopold Parts ; Joseph W. Carlson ; Madeline A. Crosby ; Matthew D. Rasmussen ; Sushmita Roy ; Ameya N. Deoras ; J. Graham Ruby ; Julius Brennecke ; Harvard FlyBase curators ; Berkeley Drosophila Genome Project ; Emily Hodges ; Angie S. Hinrichs ; Anat Caspi ; Benedict Paten ; Seung-Won Park ; Mira V. Han ; Morgan L. Maeder ; Benjamin J. Polansky ; Bryanne E. Robson ; Stein Aerts ; Jacques van Helden ; Bassem Hassan ; Donald G. Gilbert ; Deborah A. Eastman ; Michael Rice ; Michael Weir ; Matthew W. Hahn ; Yongkyu Park ; Colin N. Dewey ; Lior Pachter ; W. James Kent ; David Haussler ; Eric C. Lai ; David P. Bartel ; Gregory J. Hannon ; Thomas C. Kaufman ; Michael B. Eisen ; Andrew G. Clark ; Douglas Smith ; Susan E. Celniker ; William M. Gelbart ; Manolis Kellis ; Harvard FlyBase curators ; Berkeley Drosophila Genome Project

刊名：Nature

出版年：2007

作者：Katherine S. Pollard ; Sofie R. Salama ; Nelle Lambert ; Marie-Alexandra Lambot ; Sandra Coppens ; Jakob S. Pedersen ; Sol Katzman ; Bryan King ; Courtney Onodera ; Adam Siepel ; Andrew D. Kern ; Colette Dehay ; Haller Igel ; Manuel Ares ; Jr ; Pierre VanderhaeghenandDavid Haussler

刊名：Nature

出版年：2006