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1.Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences
作者：Serena Nik-Zainal ; Helen Davies ; Johan Staaf ; Manasa Ramakrishna ; Dominik Glodzik ; Xueqing Zou ; Inigo Martincorena ; Ludmil B. Alexandrov ; Sancha Martin ; David C. Wedge ; Peter Van Loo ; Young Seok Ju ; Marcel Smid ; Arie B. Brinkman ; Sandro Morganella ; Miriam R. Aure ; Ole Christian Lingjæ ; rde ; Anita Langerød ; Markus Ringnér ; Sung-Min Ahn ; Sandrine Boyault ; Jane E. Brock ; Annegien Broeks ; Adam Butler ; Christine Desmedt ; Luc Dirix ; Serge Dronov ; Aquila Fatima ; John A. Foekens ; Moritz Gerstung ; Gerrit K. J. Hooijer ; Se Jin Jang ; David R. Jones ; Hyung-Yong Kim ; Tari A. King ; Savitri Krishnamurthy ; Hee Jin Lee ; Jeong-Yeon Lee ; Yilong Li ; Stuart McLaren ; Andrew Menzies ; Ville Mustonen ; Sarah O’Meara ; Iris Pauporté ; Xavier Pivot ; Colin A. Purdie ; Keiran Raine ; Kamna Ramakrishnan ; F. Germá ; n Rodrí ; guez-Gonzá ; lez ; Gilles Romieu ; Anieta M. Sieuwerts ; Peter T. Simpson ; Rebecca Shepherd ; Lucy Stebbings ; Olafur A. Stefansson ; Jon Teague ; Stefania Tommasi ; Isabelle Treilleux ; Gert G. Van den Eynden ; Peter Vermeulen ; Anne Vincent-Salomon ; Lucy Yates ; Carlos Caldas ; Laura van’t Veer ; Andrew Tutt ; Stian Knappskog ; Benita Kiat Tee Tan ; Jos Jonkers ; Å ; ke Borg ; Naoto T. Ueno ; Christos Sotiriou ; Alain Viari ; P. Andrew Futreal ; Peter J. Campbell ; Paul N. Span ; Steven Van Laere ; Sunil R. Lakhani ; Jorunn E. Eyfjord ; Alastair M. Thompson ; Ewan Birney ; Hendrik G. Stunnenberg ; Marc J. van de Vijver ; John W. M. Martens ; Anne-Lise Bø ; rresen-Dale ; Andrea L. Richardson ; Gu Kong ; Gilles Thomas ; Michael R. Stratton
刊名：Nature
出版年：2016
3.Mutational signatures of ionizing radiation in second malignancies
作者：Sam Behjati ; Gunes Gundem ; David C. Wedge ; Nicola D. Roberts ; Patrick S. Tarpey ; Susanna L. Cooke ; Peter Van Loo ; Ludmil B. Alexandrov ; Manasa Ramakrishna ; Helen Davies ; Serena Nik-Zainal ; Claire Hardy ; Calli Latimer ; Keiran M. Raine ; Lucy Stebbings ; Andy Menzies ; David Jones ; Rebecca Shepherd ; Adam P. Butler ; Jon W. Teague ; < ; span class=' ; extra' ; > ; Mette Jorgensen ; Bhavisha Khatri ; Nischalan Pillay ; Adam Shlien ; P. Andrew Futreal ; Christophe Badie ; ICGC Prostate Group ; Colin S. Cooper ; Rosalind A. Eeles ; Douglas Easton ; Christopher Foster ; David E. Neal ; Daniel S. Brewer ; Freddie Hamdy ; Yong-Jie Lu ; Andrew G. Lynch ; Charlie E. Massi ; Anthony Ng ; Hayley C. Whitaker ; Yongwei Yu ; Hongwei Zhang ; Elizabeth Bancroft ; Dan Berney ; Niedzica Camacho ; Cathy Corbishley ; Tokhir Dadaev ; Nening Dennis ; Tim Dudderidge ; Sandra Edwards ; Cyril Fisher ; Jilur Ghori ; Vincent J. Gnanapragasam ; Christopher Greenman ; Steve Hawkins ; Steven Hazell ; Will Howat ; Katalin Karaszi ; Jonathan Kay ; Zsofia Kote-Jarai ; Barbara Kremeyer ; Pardeep Kumar ; Adam Lambert ; Daniel Leongamornlert ; Naomi Livni ; Hayley Luxton ; Lucy Matthews ; Erik Mayer ; Susan Merson ; David Nicol ; Christopher Ogden ; Sarah O’Meara ; Gill Pelvender ; Nimish C. Shah ; Simon Tavare ; Sarah Thomas ; Alan Thompson ; Claire Verrill ; Anne Warren ; Jorge Zamora ; Ultan McDermott ; G. Steven Bova ; Andrea L. Richardson ; Adrienne M. Flanagan ; Michael R. Stratton ; Peter J. Campbell
刊名：Nature Communications
出版年：2016
5.A comprehensive assessment of somatic mutation detection in cancer using whole-genome sequencing
作者：Tyler S. Alioto ; Ivo Buchhalter ; Sophia Derdak ; Barbara Hutter ; Matthew D. Eldridge ; Eivind Hovig ; Lawrence E. Heisler ; Timothy A. Beck ; Jared T. Simpson ; Laurie Tonon ; Anne-Sophie Sertier ; Ann-Marie Patch ; Natalie Jä ; ger ; Philip Ginsbach ; Ruben Drews ; Nagarajan Paramasivam ; Rolf Kabbe ; Sasithorn Chotewutmontri ; Nicolle Diessl ; Christopher Previti ; Sabine Schmidt ; Benedikt Brors ; Lars Feuerbach ; Michael Heinold ; Susanne Grö ; bner ; Andrey Korshunov ; Patrick S. Tarpey ; Adam P. Butler ; Jonathan Hinton ; David Jones ; Andrew Menzies ; Keiran Raine ; Rebecca Shepherd ; Lucy Stebbings ; Jon W. Teague ; Paolo Ribeca ; Francesc Castro Giner ; Sergi Beltran ; Emanuele Raineri ; Marc Dabad ; Simon C. Heath ; Marta Gut ; Robert E. Denroche ; Nicholas J. Harding ; Takafumi N. Yamaguchi ; Akihiro Fujimoto ; Hidewaki Nakagawa ; Ví ; ctor Quesada ; Rafael Valdé ; s-Mas ; Sigve Nakken ; Daniel Vodák ; Lawrence Bower ; Andrew G. Lynch ; Charlotte L. Anderson ; Nicola Waddell ; John V. Pearson ; Sean M. Grimmond ; Myron Peto ; Paul Spellman ; Minghui He ; Cyriac Kandoth ; Semin Lee ; John Zhang ; Louis Lé ; tourneau ; Singer Ma ; Sahil Seth ; David Torrents ; Liu Xi ; David A. Wheeler ; Carlos Ló ; pez-Otín ; Elí ; as Campo ; Peter J. Campbell ; Paul C. Boutros ; Xose S. Puente ; Daniela S. Gerhard ; Stefan M. Pfister ; John D. McPherson ; Thomas J. Hudson ; Matthias Schlesner ; Peter Lichter ; Roland Eils ; David T. W. Jones ; Ivo G. Gut
刊名：Nature Communications
出版年：2015
7.Integrating sequence and array data to create an improved 1000 Genomes Project haplotype reference panel
作者：Olivier Delaneau ; Jonathan Marchini ; The 1000 Genomes Project Consortium ; Gil A. McVean ; Peter Donnelly ; Gerton Lunter ; Jonathan L. Marchini ; Simon Myers ; Anjali Gupta-Hinch ; Zamin Iqbal ; Iain Mathieson ; Andy Rimmer ; Dionysia K. Xifara ; Angeliki Kerasidou ; Claire Churchhouse ; Olivier Delaneau ; David M. Altshuler ; Stacey B. Gabriel ; Eric S. Lander ; Namrata Gupta ; < ; span class=' ; extra' ; > ; Mark J. Daly ; Mark A. DePristo ; Eric Banks ; Gaurav Bhatia ; Mauricio O. Carneiro ; Guillermo del Angel ; Giulio Genovese ; Robert E. Handsaker ; Chris Hart ; Steven A. McCarroll ; James C. Nemesh ; Ryan E. Poplin ; Stephen F. Schaffner ; Khalid Shakir ; Pardis C. Sabeti ; Sharon R. Grossman ; Shervin Tabrizi ; Ridhi Tariya ; Heng Li ; David Reich ; Richard M. Durbin ; Matthew E. Hurles ; Senduran Balasubramaniam ; John Burton ; Petr Danecek ; Thomas M. Keane ; Anja Kolb-Kokocinski ; Shane McCarthy ; James Stalker ; Michael Quail ; Qasim Ayub ; Yuan Chen ; Alison J. Coffey ; Vincenza Colonna ; Ni Huang ; Luke Jostins ; Aylwyn Scally ; Klaudia Walter ; Yali Xue ; Yujun Zhang ; Ben Blackburne ; Sarah J. Lindsay ; Zemin Ning ; Adam Frankish ; Jennifer Harrow ; Chris Tyler-Smith ; Gonalo R. Abecasis ; Hyun Min Kang ; Paul Anderson ; Tom Blackwell ; Fabio Busonero ; Christian Fuchsberger ; Goo Jun ; Andrea Maschio ; Eleonora Porcu ; Carlo Sidore ; Adrian Tan ; Mary Kate Trost ; David R. Bentley ; Russell Grocock ; Sean Humphray ; Terena James ; Zoya Kingsbury ; Markus Bauer ; R. Keira Cheetham ; Tony Cox ; Michael Eberle ; Lisa Murray ; Richard Shaw ; Aravinda Chakravarti ; Andrew G. Clark ; Alon Keinan ; Juan L. Rodriguez-Flores ; Francisco M. De La Vega ; Jeremiah Degenhardt ; Evan E. Eichler ; Paul Flicek ; Laura Clarke ; Rasko Leinonen ; Richard E. Smith ; Xiangqun Zheng-Bradley ; Kathryn Beal ; Fiona Cunningham ; Javier Herrero ; William M. McLaren ; Graham R. S. Ritchie ; Jonathan Barker ; Gavin Kelman ; Eugene Kulesha ; Rajesh Radhakrishnan ; Asier Roa ; Dmitriy Smirnov ; Ian Streeter ; Iliana Toneva ; Richard A. Gibbs ; Huyen Dinh ; Christie Kovar ; Sandra Lee ; Lora Lewis ; Donna Muzny ; Jeff Reid ; Min Wang ; Fuli Yu ; Matthew Bainbridge ; Danny Challis ; Uday S. Evani ; James Lu ; Uma Nagaswamy ; Aniko Sabo ; Yi Wang ; Jin Yu ; Gerald Fowler ; Walker Hale ; Divya Kalra ; Eric D. Green ; Bartha M. Knoppers ; Jan O. Korbel ; Tobias Rausch ; Adrian M. Sttz ; Charles Lee ; Lauren Griffin ; Chih-Heng Hsieh ; Ryan E. Mills ; Marcin von Grotthuss ; Chengsheng Zhang ; Xinghua Shi ; Hans Lehrach ; Ralf Sudbrak ; Vyacheslav S. Amstislavskiy ; Matthias Lienhard ; Florian Mertes ; Marc Sultan ; Bernd Timmermann ; Marie-Laure Yaspo ; Sudbrak ; Ralf Herwig ; Elaine R. Mardis ; Richard K. Wilson ; Lucinda Fulton ; Robert Fulton ; George M. Weinstock ; Asif Chinwalla ; Li Ding ; David Dooling ; Daniel C. Koboldt ; Michael D. McLellan ; John W. Wallis ; Michael C. Wendl ; Qunyuan Zhang ; Gabor T. Marth ; Erik P. Garrison ; Deniz Kural ; Wan-Ping Lee ; Wen Fung Leong ; Alistair N. Ward ; Jiantao Wu ; Mengyao Zhang ; Deborah A. Nickerson ; Can Alkan ; Fereydoun Hormozdiari ; Arthur Ko ; Peter H. Sudmant ; Jeanette P. Schmidt ; Christopher J. Davies ; Jeremy Gollub ; Teresa Webster ; Brant Wong ; Yiping Zhan ; Stephen T. Sherry ; Chunlin Xiao ; Deanna Church ; Victor Ananiev ; Zinaida Belaia ; Dimitriy Beloslyudtsev ; Nathan Bouk ; Chao Chen ; Robert Cohen ; Charles Cook ; John Garner ; Timothy Hefferon ; Mikhail Kimelman ; Chunlei Liu ; John Lopez ; Peter Meric ; Yuri Ostapchuk ; Lon Phan ; Sergiy Ponomarov ; Valerie Schneider ; Eugene Shekhtman ; Karl Sirotkin ; Douglas Slotta ; Hua Zhang ; Jun Wang ; Xiaodong Fang ; Xiaosen Guo ; Min Jian ; Hui Jiang ; Xin Jin ; Guoqing Li ; Jingxiang Li ; Yingrui Li ; Xiao Liu ; Yao Lu ; Xuedi Ma ; Shuaishuai Tai ; Meifang Tang ; Bo Wang ; Guangbiao Wang ; Honglong Wu ; Renhua Wu ; Ye Yin ; Wenwei Zhang ; Jiao Zhao ; Meiru Zhao ; Xiaole Zheng ; Lachlan J.M. Coin ; Lin Fang ; Qibin Li ; Zhenyu Li ; Haoxiang Lin ; Binghang Liu ; Ruibang Luo ; Haojing Shao ; Bingqiang Wang ; Yinlong Xie ; Chen Ye ; Chang Yu ; Hancheng Zheng ; Hongmei Zhu ; Hongyu Cai ; Hongzhi Cao ; Yeyang Su ; Zhongming Tian ; Huanming Yang ; Ling Yang ; Jiayong Zhu ; Zhiming Cai ; Jian Wang ; Marcus W. Albrecht ; Tatiana A. Borodina ; Adam Auton ; Seungtai C. Yoon ; Jayon Lihm ; Vladimir Makarov ; Hanjun Jin ; Wook Kim ; Ki Cheol Kim ; Srikanth Gottipati ; Danielle Jones ; David N. Cooper ; Edward V. Ball ; Peter D. Stenson ; Bret Barnes ; Scott Kahn ; Kai Ye ; Mark A. Batzer ; Miriam K. Konkel ; Jerilyn A. Walker ; Daniel G. MacArthur ; Monkol Lek ; Mark D. Shriver ; Carlos D. Bustamante ; Simon Gravel ; Eimear E. Kenny ; Jeffrey M. Kidd ; Phil Lacroute ; Brian K. Maples ; Andres Moreno-Estrada ; Fouad Zakharia ; Brenna Henn ; Karla Sandoval ; Jake K. Byrnes ; Eran Halperin ; Yael Baran ; David W. Craig ; Alexis Christoforides ; Tyler Izatt ; Ahmet A. Kurdoglu ; Shripad A. Sinari ; Nils Homer ; Kevin Squire ; Jonathan Sebat ; Vineet Bafna ; Kenny Ye ; Esteban G. Burchard ; Ryan D. Hernandez ; Christopher R. Gignoux ; David Haussler ; Sol J. Katzman ; W. James Kent ; Bryan Howie ; Andres Ruiz-Linares ; Emmanouil T. Dermitzakis ; Tuuli Lappalainen ; Scott E. Devine ; Xinyue Liu ; Ankit Maroo ; Luke J. Tallon ; Jeffrey A. Rosenfeld ; Leslie P. Michelson ; Andrea Angius ; Francesco Cucca ; Serena Sanna ; Abigail Bigham ; Chris Jones ; Fred Reinier ; Yun Li ; Robert Lyons ; David Schlessinger ; Philip Awadalla ; Alan Hodgkinson ; Taras K. Oleksyk ; Juan C. Martinez-Cruzado ; Yunxin Fu ; Xiaoming Liu ; Momiao Xiong ; Lynn Jorde ; David Witherspoon ; Jinchuan Xing ; Brian L. Browning ; Iman Hajirasouliha ; Ken Chen ; Cornelis A. Albers ; Mark B. Gerstein ; Alexej Abyzov ; Jieming Chen ; Yao Fu ; Lukas Habegger ; Arif O. Harmanci ; Xinmeng Jasmine Mu ; Cristina Sisu ; Suganthi Balasubramanian ; Mike Jin ; Ekta Khurana ; Declan Clarke ; Jacob J. Michaelson ; Chris OSullivan ; Kathleen C. Barnes ; Neda Gharani ; Lorraine H. Toji ; Norman Gerry ; Jane S. Kaye ; Alastair Kent ; Rasika Mathias ; Pilar N. Ossorio ; Michael Parker ; Charles N. Rotimi ; Charmaine D. Royal ; Sarah Tishkoff ; Marc Via ; Walter Bodmer ; Gabriel Bedoya ; Gao Yang ; Chu Jia You ; Andres Garcia-Montero ; Alberto Orfao ; Julie Dutil ; Lisa D. Brooks ; Adam L. Felsenfeld ; Jean E. McEwen ; Nicholas C. Clemm ; Mark S. Guyer ; Jane L. Peterson ; Audrey Duncanson ; Michael Dunn ; Leena Peltonenz
刊名：Nature Communications
出版年：2014
8.Processed pseudogenes acquired somatically during cancer development
作者：Susanna L. Cooke ; Adam Shlien ; John Marshall ; Christodoulos P. Pipinikas ; Inigo Martincorena ; Jose M.C. Tubio ; Yilong Li ; Andrew Menzies ; Laura Mudie ; Manasa Ramakrishna ; Lucy Yates ; Helen Davies ; Niccolo Bolli ; Graham R. Bignell ; Patrick S. Tarpey ; Sam Behjati ; Serena Nik-Zainal ; Elli Papaemmanuil ; Vitor H. Teixeira ; Keiran Raine ; Sarah Oᯍeara ; Maryam S. Dodoran ; Jon W. Teague ; Adam P. Butler ; Christine Iacobuzio-Donahue ; Thomas Santarius ; Richard G. Grundy ; David Malkin ; Mel Greaves ; Nikhil Munshi ; Adrienne M. Flanagan ; David Bowtell ; Sancha Martin ; Denis Larsimont ; Jorge S. Reis-Filho ; Alex Boussioutas ; Jack A. Taylor ; Neil D. Hayes ; Sam M. Janes ; P. Andrew Futreal ; Michael R. Stratton ; Ultan McDermott ; Peter J. Campbell ; ICGC Breast Cancer Group ; Elena Provenzano ; Marc van de Vijver ; Andrea L. Richardson ; Colin Purdie ; Sarah Pinder ; Gaetan Mac Grogan ; Anne Vincent-Salomon ; Denis Larsimont ; Dorthe Grabau ; Torill Sauer ; ?ystein Garred ; Anna Ehinger ; Gert G. Van den Eynden ; C.H.M van Deurzen ; Roberto Salgado ; Jane E. Brock ; Sunil R. Lakhani ; Dilip D. Giri ; Laurent Arnould ; Jocelyne Jacquemier ; Isabelle Treilleux ; Carlos Caldas ; Suet-Feung Chin ; Aquila Fatima ; Alastair M. Thompson ; Alasdair Stenhouse ; John Foekens ; John Martens ; Anieta Sieuwerts ; Arjen Brinkman ; Henk Stunnenberg ; Paul N. Span ; Fred Sweep ; Christine Desmedt ; Christos Sotiriou ; Gilles Thomas ; Annegein Broeks ; Anita Langerod ; Samuel Aparicio ; Peter T. Simpson ; Laura van ᯴ Veer ; J讲unn Erla Eyfj?rd ; Holmfridur Hilmarsdottir ; Jon G. Jonasson ; Anne-Lise B?rresen-Dale ; Ming Ta Michael Lee ; Bernice Huimin Wong ; Benita Kiat Tee Tan ; Gerrit K.J. Hooijer
刊名：Nature Communications
出版年：2014
9.Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia
作者：Xose S. Puente ; Magda Pinyol ; Ví ; ctor Quesada ; Laura Conde ; Gonzalo R. Ordó ; ñ ; ez ; Neus Villamor ; Georgia Escaramis ; Pedro Jares ; Sí ; lvia Beà ; Marcos Gonzá ; lez-Dí ; az ; Laia Bassaganyas ; Tycho Baumann ; Manel Juan ; Mó ; nica Ló ; pez-Guerra ; Dolors Colomer ; José ; M. C. Tubío ; Cristina Ló ; pez ; Alba Navarro ; Cristian Tornador ; Marta Aymerich ; Marí ; a Rozman ; Jesú ; s M. Herná ; ndez ; Diana A. Puente ; José ; M. P. Freije ; Gloria Velasco ; Ana Gutié ; rrez-Ferná ; ndez ; Dolors Costa ; Anna Carrió ; Sara Guijarro ; Anna Enjuanes ; Lluí ; s Herná ; ndez ; Jordi Yagüe ; Pilar Nicolás ; Carlos M. Romeo-Casabona ; Heinz Himmelbauer ; Ester Castillo ; Juliane C. Dohm ; Silvia de Sanjosé ; Miguel A. Piris ; Enrique de Alava ; Jesú ; s San Miguel ; Romina Royo ; Josep L. Gelpí ; David Torrents ; Modesto Orozco ; David G. Pisano ; Alfonso Valencia ; Roderic Guigó ; Mó ; nica Bayés ; Simon Heath ; Marta Gut ; Peter Klatt ; John Marshall ; Keiran Raine ; Lucy A. Stebbings ; P. Andrew Futreal ; Michael R. Stratton ; Peter J. Campbell ; Ivo Gut ; Armando Ló ; pez-Guillermo ; Xavier Estivill ; Emili Montserrat ; Carlos Ló ; pez-Otín ; Elí ; as Campo
刊名：Nature
出版年：2011
10.The landscape of cancer genes and mutational processes in breast cancer
作者：Philip J. Stephens ; Patrick S. Tarpey ; Helen Davies ; Peter Van Loo ; Chris Greenman ; David C. Wedge ; Serena Nik-Zainal ; Sancha Martin ; Ignacio Varela ; Graham R. Bignell ; Lucy R. Yates ; Elli Papaemmanuil ; David Beare ; Adam Butler ; Angela Cheverton ; John Gamble ; Jonathan Hinton ; Mingming Jia ; Alagu Jayakumar ; David Jones ; Calli Latimer ; King Wai Lau ; Stuart McLaren ; David J. McBride ; Andrew Menzies ; Laura Mudie ; Keiran Raine ; Roland Rad ; Michael Spencer Chapman ; Jon Teague ; Douglas Easton ; Anita Langerød ; The Oslo Breast Cancer Consortium (OSBREAC) ; Ming Ta Michael Lee ; Chen-Yang Shen ; Benita Tan Kiat Tee ; Bernice Wong Huimin ; Annegien Broeks ; Ana Cristina Vargas ; Gulisa Turashvili ; John Martens ; Aquila Fatima ; Penelope Miron ; Suet-Feung Chin ; Gilles Thomas ; Sandrine Boyault ; Odette Mariani ; Sunil R. Lakhani ; Marc van de Vijver ; Laura van ‘t Veer ; John Foekens ; Christine Desmedt ; Christos Sotiriou ; Andrew Tutt ; Carlos Caldas ; Jorge S. Reis-Filho ; Samuel A. J. R. Aparicio ; Anne Vincent Salomon ; Anne-Lise Bø ; rresen-Dale ; Andrea L. Richardson ; Peter J. Campbell ; P. Andrew Futreal ; Michael R. Stratton
关键词：Cancer ; Genetics ; Genomics
刊名：Nature
出版年：2012
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