作者：Hongyu Li ; Hennie Valkenier ; Luke W. Judd ; Peter R. Brotherhood ; Sabir Hussain ; James A. Cooper ; Ond艡ej Jur膷ek ; Hazel A. Sparkes ; David N. Sheppard ; Anthony P. Davis

关键词：Supramolecular chemistry ; Membranes ; Medicinal chemistry

刊名：Nature Chemistry

出版年：2016

作者：Dmitri D. Pervouchine ; Sarah Djebali ; Alessandra Breschi ; Carrie A. Davis ; Pablo Prieto Barja ; Alex Dobin ; Andrea Tanzer ; Julien Lagarde ; Chris Zaleski ; Lei-Hoon See ; Meagan Fastuca ; Jorg Drenkow ; Huaien Wang ; Giovanni Bussotti ; Baikang Pei ; Suganthi Balasubramanian ; Jean Monlong ; Arif Harmanci ; Mark Gerstein ; Michael A. Beer ; Cedric Notredame ; Roderic Guigó ; Thomas R. Gingeras

关键词：Biological sciences ; Evolution ; Genetics

刊名：Nature Communications

出版年：2015

作者：James B. Brown ; Nathan Boley ; Robert Eisman ; Gemma E. May ; Marcus H. Stoiber ; Michael O. Duff ; Ben W. Booth ; Jiayu Wen ; Soo Park ; Ana Maria Suzuki ; Kenneth H. Wan ; Charles Yu ; Dayu Zhang ; Joseph W. Carlson ; Lucy Cherbas ; Brian D. Eads ; David Miller ; Keithanne Mockaitis ; Johnny Roberts ; Carrie A. Davis ; Erwin Frise ; Ann S. Hammonds ; Sara Olson ; Sol Shenker ; David Sturgill ; Anastasia A. Samsonova ; Richard Weiszmann ; Garret Robinson ; Juan Hernandez ; Justen Andrews ; Peter J. Bickel ; Piero Carninci ; Peter Cherbas ; Thomas R. Gingeras ; Roger A. Hoskins ; Thomas C. Kaufman ; Eric C. Lai ; Brian Oliver ; Norbert Perrimon ; Brenton R. Graveley ; Susan E. Celniker

关键词：Gene expression profiling ; Transcriptomics ; Genomics ; Data integration

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Feng Yue ; Yong Cheng ; Alessandra Breschi ; Jeff Vierstra ; Weisheng Wu ; Tyrone Ryba ; Richard Sandstrom ; Zhihai Ma ; Carrie Davis ; Benjamin D. Pope ; Yin Shen ; Dmitri D. Pervouchine ; Sarah Djebali ; Robert E. Thurman ; Rajinder Kaul ; Eric Rynes ; Anthony Kirilusha ; Georgi K. Marinov ; Brian A. Williams ; Diane Trout ; Henry Amrhein ; Katherine Fisher-Aylor ; Igor Antoshechkin ; Gilberto DeSalvo ; Lei-Hoon See ; Meagan Fastuca ; Jorg Drenkow ; Chris Zaleski ; Alex Dobin ; Pablo Prieto ; Julien Lagarde ; Giovanni Bussotti ; Andrea Tanzer ; Olgert Denas ; Kanwei Li ; M. A. Bender ; Miaohua Zhang ; Rachel Byron ; Mark T. Groudine ; David McCleary ; Long Pham ; Zhen Ye ; Samantha Kuan ; Lee Edsall ; Yi-Chieh Wu ; Matthew D. Rasmussen ; Mukul S. Bansal ; Manolis Kellis ; Cheryl A. Keller ; Christapher S. Morrissey ; Tejaswini Mishra ; Deepti Jain ; Nergiz Dogan ; Robert S. Harris ; Philip Cayting ; Trupti Kawli ; Alan P. Boyle ; Ghia Euskirchen ; Anshul Kundaje ; Shin Lin ; Yiing Lin ; Camden Jansen ; Venkat S. Malladi ; Melissa S. Cline ; Drew T. Erickson ; Vanessa M. Kirkup ; Katrina Learned ; Cricket A. Sloan ; Kate R. Rosenbloom ; Beatriz Lacerda de Sousa ; Kathryn Beal ; Miguel Pignatelli ; Paul Flicek ; Jin Lian ; Tamer Kahveci ; Dongwon Lee ; W. James Kent ; Miguel Ramalho Santos ; Javier Herrero ; Cedric Notredame ; Audra Johnson ; Shinny Vong ; Kristen Lee ; Daniel Bates ; Fidencio Neri ; Morgan Diegel ; Theresa Canfield ; Peter J. Sabo ; Matthew S. Wilken ; Thomas A. Reh ; Erika Giste ; Anthony Shafer ; Tanya Kutyavin ; Eric Haugen ; Douglas Dunn ; Alex P. Reynolds ; Shane Neph ; Richard Humbert ; R. Scott Hansen ; Marella De Bruijn ; Licia Selleri ; Alexander Rudensky ; Steven Josefowicz ; Robert Samstein ; Evan E. Eichler ; Stuart H. Orkin ; Dana Levasseur ; Thalia Papayannopoulou ; Kai-Hsin Chang ; Arthur Skoultchi ; Srikanta Gosh ; Christine Disteche ; Piper Treuting ; Yanli Wang ; Mitchell J. Weiss ; Gerd A. Blobel ; Xiaoyi Cao ; Sheng Zhong ; Ting Wang ; Peter J. Good ; Rebecca F. Lowdon ; Leslie B. Adams ; Xiao-Qiao Zhou ; Michael J. Pazin ; Elise A. Feingold ; Barbara Wold ; James Taylor ; Ali Mortazavi ; Sherman M. Weissman ; John A. Stamatoyannopoulos ; Michael P. Snyder ; Roderic Guigo ; Thomas R. Gingeras ; David M. Gilbert ; Ross C. Hardison ; Michael A. Beer ; Bing Ren ; The Mouse ENCODE Consortium

关键词：Epigenomics

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Mark B. Gerstein ; Joel Rozowsky ; Koon-Kiu Yan ; Daifeng Wang ; Chao Cheng ; James B. Brown ; Carrie A. Davis ; LaDeana Hillier ; Cristina Sisu ; Jingyi Jessica Li ; Baikang Pei ; Arif O. Harmanci ; Michael O. Duff ; Sarah Djebali ; Roger P. Alexander ; Burak H. Alver ; Raymond Auerbach ; Kimberly Bell ; Peter J. Bickel ; Max E. Boeck ; Nathan P. Boley ; Benjamin W. Booth ; Lucy Cherbas ; Peter Cherbas ; Chao Di ; Alex Dobin ; Jorg Drenkow ; Brent Ewing ; Gang Fang ; Megan Fastuca ; Elise A. Feingold ; Adam Frankish ; Guanjun Gao ; Peter J. Good ; Roderic Guigó ; Ann Hammonds ; Jen Harrow ; Roger A. Hoskins ; Cé ; dric Howald ; Long Hu ; Haiyan Huang ; Tim J. P. Hubbard ; Chau Huynh ; Sonali Jha ; Dionna Kasper ; Masaomi Kato ; Thomas C. Kaufman ; Robert R. Kitchen ; Erik Ladewig ; Julien Lagarde ; Eric Lai ; Jing Leng ; Zhi Lu ; Michael MacCoss ; Gemma May ; Rebecca McWhirter ; Gennifer Merrihew ; David M. Miller ; Ali Mortazavi ; Rabi Murad ; Brian Oliver ; Sara Olson ; Peter J. Park ; Michael J. Pazin ; Norbert Perrimon ; Dmitri Pervouchine ; Valerie Reinke ; Alexandre Reymond ; Garrett Robinson ; Anastasia Samsonova ; Gary I. Saunders ; Felix Schlesinger ; Anurag Sethi ; Frank J. Slack ; William C. Spencer ; Marcus H. Stoiber ; Pnina Strasbourger ; Andrea Tanzer ; Owen A. Thompson ; Kenneth H. Wan ; Guilin Wang ; Huaien Wang ; Kathie L. Watkins ; Jiayu Wen ; Kejia Wen ; Chenghai Xue ; Li Yang ; Kevin Yip ; Chris Zaleski ; Yan Zhang ; Henry Zheng ; Steven E. Brenner ; Brenton R. Graveley ; Susan E. Celniker ; Thomas R. Gingeras ; Robert Waterston

关键词：Comparative genomics ; Transcriptomics

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Sarah Djebali ; Carrie A. Davis ; Angelika Merkel ; Alex Dobin ; Timo Lassmann ; Ali Mortazavi ; Andrea Tanzer ; Julien Lagarde ; Wei Lin ; Felix Schlesinger ; Chenghai Xue ; Georgi K. Marinov ; Jainab Khatun ; Brian A. Williams ; Chris Zaleski ; Joel Rozowsky ; Maik Rö ; der ; Felix Kokocinski ; Rehab F. Abdelhamid ; Tyler Alioto ; Igor Antoshechkin ; Michael T. Baer ; Nadav S. Bar ; Philippe Batut ; Kimberly Bell ; Ian Bell ; Sudipto Chakrabortty ; Xian Chen ; Jacqueline Chrast ; Joao Curado ; Thomas Derrien ; Jorg Drenkow ; Erica Dumais ; Jacqueline Dumais ; Radha Duttagupta ; Emilie Falconnet ; Meagan Fastuca ; Kata Fejes-Toth ; Pedro Ferreira ; Sylvain Foissac ; Melissa J. Fullwood ; Hui Gao ; David Gonzalez ; Assaf Gordon ; Harsha Gunawardena ; Cedric Howald ; Sonali Jha ; Rory Johnson ; Philipp Kapranov ; Brandon King ; Colin Kingswood ; Oscar J. Luo ; Eddie Park ; Kimberly Persaud ; Jonathan B. Preall ; Paolo Ribeca ; Brian Risk ; Daniel Robyr ; Michael Sammeth ; Lorian Schaffer ; Lei-Hoon See ; Atif Shahab ; Jorgen Skancke ; Ana Maria Suzuki ; Hazuki Takahashi ; Hagen Tilgner ; Diane Trout ; Nathalie Walters ; Huaien Wang ; John Wrobel ; Yanbao Yu ; Xiaoan Ruan ; Yoshihide Hayashizaki ; Jennifer Harrow ; Mark Gerstein ; Tim Hubbard ; Alexandre Reymond ; Stylianos E. Antonarakis ; Gregory Hannon ; Morgan C. Giddings ; Yijun Ruan ; Barbara Wold ; Piero Carninci ; Roderic Guigó ; Thomas R. Gingeras

关键词：Genetics ; Genomics ; Molecular biology

刊名：Nature

出版年：2012

作者：Brenton R. Graveley ; Angela N. Brooks ; Joseph W. Carlson ; Michael O. Duff ; Jane M. Landolin ; Li Yang ; Carlo G. Artieri ; Marijke J. van Baren ; Nathan Boley ; Benjamin W. Booth ; James B. Brown ; Lucy Cherbas ; Carrie A. Davis ; Alex Dobin ; Renhua Li ; Wei Lin ; John H. Malone ; Nicolas R. Mattiuzzo ; David Miller ; David Sturgill ; Brian B. Tuch ; Chris Zaleski ; Dayu Zhang ; Marco Blanchette ; Sandrine Dudoit ; Brian Eads ; Richard E. Green ; Ann Hammonds ; Lichun Jiang ; Phil Kapranov ; Laura Langton ; Norbert Perrimon ; Jeremy E. Sandler ; Kenneth H. Wan ; Aarron Willingham ; Yu Zhang ; Yi Zou ; Justen Andrews ; Peter J. Bickel ; Steven E. Brenner ; Michael R. Brent ; Peter Cherbas ; Thomas R. Gingeras ; Roger A. Hoskins ; Thomas C. Kaufman ; Brian Oliver ; Susan E. Celniker

关键词：Genetics and genomics ; Developmental biology ; Molecular biology

刊名：Nature

出版年：2011

作者：J. W. Alldredge ; Jinho Lee ; K. McElroy ; M. Wang ; K. Fujita ; Y. Kohsaka ; C. Taylor ; H. Eisaki ; S. Uchida ; P. J. Hirschfeld ; J. C. Davis

刊名：Nature Physics

出版年：2008

作者：S. H. Pan ; J. P. O' ; Neal ; R. L. Badzey ; C. Chamon ; H. Ding ; J. R. Engelbrecht ; Z. Wang ; H. Eisaki ; S. Uchida ; A. K. Gupta ; K.-W. Ng ; E. W. Hudson ; K. M. LangandJ. C. Davis

刊名：Nature

出版年：2001

作者：International Human Genome Sequencing ConsortiumEric S. Lander ; Lauren M. Linton ; Bruce Birren ; Chad Nusbaum ; Michael C. Zody ; Jennifer Baldwin ; Keri Devon ; Ken Dewar ; Michael Doyle ; William FitzHugh ; Roel Funke ; Diane Gage ; Katrina Harris ; Andrew Heaford ; John Howland ; Lisa Kann ; Jessica Lehoczky ; Rosie LeVine ; Paul McEwan ; Kevin McKernan ; James Meldrim ; Jill P. Mesirov ; Cher Miranda ; William Morris ; Jerome Naylor ; Christina Raymond ; Mark Rosetti ; Ralph Santos ; Andrew Sheridan ; Carrie Sougnez ; Nicole Stange-Thomann ; Nikola Stojanovic ; Aravind Subramanian ; Dudley WymanforWhitehead Institute for Biomedical Research ; Center for Genome Research ; Jane Rogers ; John Sulston ; Rachael Ainscough ; Stephan Beck ; David Bentley ; John Burton ; Christopher Clee ; Nigel Carter ; Alan Coulson ; Rebecca Deadman ; Panos Deloukas ; Andrew Dunham ; Ian Dunham ; Richard Durbin ; Lisa French ; Darren Grafham ; Simon Gregory ; Tim Hubbard ; Sean Humphray ; Adrienne Hunt ; Matthew Jones ; Christine Lloyd ; Amanda McMurray ; Lucy Matthews ; Simon Mercer ; Sarah Milne ; James C. Mullikin ; Andrew Mungall ; Robert Plumb ; Mark Ross ; Ratna Shownkeen ; Sarah SimsforThe Sanger Centre ; Robert H. Waterston ; Richard K. Wilson ; LaDeana W. Hillier ; John D. McPherson ; Marco A. Marra ; Elaine R. Mardis ; Lucinda A. Fulton ; Asif T. Chinwalla ; Kymberlie H. Pepin ; Warren R. Gish ; Stephanie L. Chissoe ; Michael C. Wendl ; Kim D. Delehaunty ; Tracie L. Miner ; Andrew Delehaunty ; Jason B. Kramer ; Lisa L. Cook ; Robert S. Fulton ; Douglas L. Johnson ; Patrick J. Minx ; Sandra W. CliftonforWashington University Genome Sequencing Center ; Trevor Hawkins ; Elbert Branscomb ; Paul Predki ; Paul Richardson ; Sarah Wenning ; Tom Slezak ; Norman Doggett ; Jan-Fang Cheng ; Anne Olsen ; Susan Lucas ; Christopher Elkin ; Edward Uberbacher ; Marvin FrazierforUS DOE Joint Genome Institute ; Richard A. Gibbs ; Donna M. Muzny ; Steven E. Scherer ; John B. Bouck ; Erica J. Sodergren ; Kim C. Worley ; Catherine M. Rives ; James H. Gorrell ; Michael L. Metzker ; Susan L. Naylor ; Raju S. Kucherlapati ; David L. Nelson ; George M. WeinstockforBaylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center ; Yoshiyuki Sakaki ; Asao Fujiyama ; Masahira Hattori ; Tetsushi Yada ; Atsushi Toyoda ; Takehiko Itoh ; Chiharu Kawagoe ; Hidemi Watanabe ; Yasushi Totoki ; Todd TaylorforRIKEN Genomic Sciences Center ; Jean Weissenbach ; Roland Heilig ; William Saurin ; Francois Artiguenave ; Philippe Brottier ; Thomas Bruls ; Eric Pelletier ; Catherine Robert ; Patrick WinckerforGenoscope and CNRS UMR-8030 ; André ; Rosenthal ; Matthias Platzer ; Gerald Nyakatura ; Stefan Taudien ; Andreas RumpforDepartment of Genome Analysis ; Institute of Molecular Biotechnology ; Douglas R. Smith ; Lynn Doucette-Stamm ; Marc Rubenfield ; Keith Weinstock ; Hong Mei Lee ; JoAnn DuboisforGTC Sequencing Center ; Huanming Yang ; Jun Yu ; Jian Wang ; Guyang Huang ; Jun GuforBeijing Genomics Institute/Human Genome Center ; Leroy Hood ; Lee Rowen ; Anup Madan ; Shizen QinforMultimegabase Sequencing Center ; The Institute for Systems Biology ; Ronald W. Davis ; Nancy A. Federspiel ; A. Pia Abola ; Michael J. ProctorforStanford Genome Technology Center ; Bruce A. Roe ; Feng Chen ; Huaqin PanforUniversity of Oklahoma' ; s Advanced Center for Genome Technology ; Juliane Ramser ; Hans Lehrach ; Richard ReinhardtforMax Planck Institute for Molecular Genetics ; W. Richard McCombie ; Melissa de la Bastide ; Neilay DedhiaforCold Spring Harbor Laboratory ; Lita Annenberg Hazen Genome Center ; Helmut Blö ; cker ; Klaus Hornischer ; Gabriele NordsiekforGBF—German Research Centre for Biotechnology ; Richa Agarwala ; L. Aravind ; Jeffrey A. Bailey ; Alex Bateman ; Serafim Batzoglou ; Ewan Birney ; Peer Bork ; Daniel G. Brown ; Christopher B. Burge ; Lorenzo Cerutti ; Hsiu-Chuan Chen ; Deanna Church ; Michele Clamp ; Richard R. Copley ; Tobias Doerks ; Sean R. Eddy ; Evan E. Eichler ; Terrence S. Furey ; James Galagan ; James G. R. Gilbert ; Cyrus Harmon ; Yoshihide Hayashizaki ; David Haussler ; Henning Hermjakob ; Karsten Hokamp ; Wonhee Jang ; L. Steven Johnson ; Thomas A. Jones ; Simon Kasif ; Arek Kaspryzk ; Scot Kennedy ; W. James Kent ; Paul Kitts ; Eugene V. Koonin ; Ian Korf ; David Kulp ; Doron Lancet ; Todd M. Lowe ; Aoife McLysaght ; Tarjei Mikkelsen ; John V. Moran ; Nicola Mulder ; Victor J. Pollara ; Chris P. Ponting ; Greg Schuler ; Jö ; rg Schultz ; Guy Slater ; Arian F. A. Smit ; Elia Stupka ; Joseph Szustakowki ; Danielle Thierry-Mieg ; Jean Thierry-Mieg ; Lukas Wagner ; John Wallis ; Raymond Wheeler ; Alan Williams ; Yuri I. Wolf ; Kenneth H. Wolfe ; Shiaw-Pyng Yang ; Ru-Fang Yehfor*Genome Analysis Group (listed in alphabetical order ; also includes individuals listed under other headings) ; Francis Collins ; Mark S. Guyer ; Jane Peterson ; Adam Felsenfeld ; Kris A. WetterstrandforScientific management ; National Human Genome Research Institute ; US National Institutes of Health ; Richard M. Myers ; Jeremy Schmutz ; Mark Dickson ; Jane Grimwood ; David R. CoxforStanford Human Genome Center ; Maynard V. Olson ; Rajinder Kaul ; Christopher RaymondforUniversity of Washington Genome Center ; Nobuyoshi Shimizu ; Kazuhiko Kawasaki ; Shinsei MinoshimaforDepartment of Molecular Biology ; Keio University School of Medicine ; Glen A. Evans ; Maria Athanasiou ; Roger SchultzforUniversity of Texas Southwestern Medical Center at Dallas ; Aristides PatrinosforOffice of Science ; US Department of Energy ; Michael J. MorganforThe Wellcome Trust

刊名：Nature

出版年：2001