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1.Intersecting transcription networks constrain gene regulatory evolution

作者：Trevor R. Sorrells ; Lauren N. Booth ; Brian B. Tuch ; Alexander D. Johnson

关键词：Transcriptional regulatory elements ; Molecular evolution ; Regulatory networks ; Gene regulation

刊名：Nature

出版年：2015

2.System-wide analysis of the transcriptional network of human myelomonocytic leukemia cells predicts attractor structure and phorbol-ester-induced differentiation and dedifferentiation transitions

作者：Katsumi Sakata ; Hajime Ohyanagi ; Shinji Sato ; Hiroya Nobori ; Akiko Hayashi ; Hideshi Ishii ; Carsten O. Daub ; Jun Kawai ; Harukazu Suzuki ; Toshiyuki Saito

关键词：Network topology ; Regulatory networks

刊名：Scientific Reports

出版年：2015

3.Unraveling novel TF-miRNA regulatory crosstalk in metastasis of Soft Tissue Sarcoma

作者：Devyani Samantarrai ; Mousumi Sahu ; Jyoti Roy ; Bedanta Ballav Mohanty ; Garima Singh ; Chandra Bhushan ; Bibekanand Mallick

关键词：Gene regulatory networks ; Cancer genomics

刊名：Scientific Reports

出版年：2015

4.An Arabidopsis gene regulatory network for secondary cell wall synthesis

作者：M. Taylor-Teeples ; L. Lin ; M. de Lucas ; G. Turco ; T. W. Toal ; A. Gaudinier ; N. F. Young ; G. M. Trabucco ; M. T. Veling ; R. Lamothe ; P. P. Handakumbura ; G. Xiong ; C. Wang ; J. Corwin ; A. Tsoukalas ; L. Zhang ; D. Ware ; M. Pauly ; D. J. Kliebenstein ; K. Dehesh ; I. Tagkopoulos ; G. Breton ; J. L. Pruneda-Paz ; S. E. Ahnert ; S. A. Kay ; S. P. Hazen ; S. M. Brady

关键词：Regulatory networks ; Plant development

刊名：Nature

出版年：2015

5.Gene regulatory network inference using fused LASSO on multiple data sets

作者：Nooshin Omranian ; Jeanne M. O. Eloundou-Mbebi ; Bernd Mueller-Roeber ; Zoran Nikoloski

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

6.Expanding antigen-specific regulatory networks to treat autoimmunity

作者：Xavier Clemente-Casares ; Jesus Blanco ; Poornima Ambalavanan ; Jun Yamanouchi ; Santiswarup Singha ; Cesar Fandos ; Sue Tsai ; Jinguo Wang ; Nahir Garabatos ; Cristina Izquierdo ; Smriti Agrawal ; Michael B. Keough ; V. Wee Yong ; Eddie James ; Anna Moore ; Yang Yang ; Thomas Stratmann ; Pau Serra ; Pere Santamaria

关键词：Autoimmunity ; Autoimmune diseases

刊名：Nature

出版年：2016

7.Transittability of complex networks and its applications to regulatory biomolecular networks

作者：Fang-Xiang Wu ; Lin Wu ; Jianxin Wang ; Juan Liu ; Luonan Chen

关键词：Network topology ; Information technology

刊名：Scientific Reports

出版年：2014

8.Discovery of a kernel for controlling biomolecular regulatory networks

作者：Junil Kim ; Sang-Min Park ; Kwang-Hyun Cho

关键词：Systems analysis ; Numerical simulations ; Regulatory networks ; Dynamic networks

刊名：Scientific Reports

出版年：2013

9.The mid-developmental transition and the evolution of animal body plans

作者：Michal Levin ; Leon Anavy ; Alison G. Cole ; Eitan Winter ; Natalia Mostov ; Sally Khair ; Naftalie Senderovich ; Ekaterina Kovalev ; David H. Silver ; Martin Feder ; Selene L. Fernandez-Valverde ; Nagayasu Nakanishi ; David Simmons ; Oleg Simakov ; Tomas Larsson ; Shang-Yun Liu ; Ayelet Jerafi-Vider ; Karina Yaniv ; Joseph F. Ryan ; Mark Q. Martindale ; Jochen C. Rink ; Detlev Arendt ; Sandie M. Degnan ; Bernard M. Degnan ; Tamar Hashimshony ; Itai Yanai

关键词：Evolutionary developmental biology ; Embryogenesis ; Gene regulatory networks

刊名：Nature

出版年：2016

10.Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins

作者：Charles Y. Lin ; Serap Erkek ; Yiai Tong ; Linlin Yin ; Alexander J. Federation ; Marc Zapatka ; Parthiv Haldipur ; Daisuke Kawauchi ; Thomas Risch ; Hans-Jö ; rg Warnatz ; Barbara C. Worst ; Bensheng Ju ; Brent A. Orr ; Rhamy Zeid ; Donald R. Polaski ; Maia Segura-Wang ; Sebastian M. Waszak ; David T. W. Jones ; Marcel Kool ; Volker Hovestadt ; Ivo Buchhalter ; Laura Sieber ; Pascal Johann ; Lukas Chavez ; Stefan Grö ; schel ; Marina Ryzhova ; Andrey Korshunov ; Wenbiao Chen ; Victor V. Chizhikov ; Kathleen J. Millen ; Vyacheslav Amstislavskiy ; Hans Lehrach ; Marie-Laure Yaspo ; Roland Eils ; Peter Lichter ; Jan O. Korbel ; Stefan M. Pfister ; James E. Bradner ; Paul A. Northcott

关键词：Cancer genomics ; CNS cancer ; Paediatric cancer ; Gene regulatory networks ; Chromatin immunoprecipitation

刊名：Nature

出版年：2016

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