Zuckerseitige Wechselwirkungen in einem DNA-RNA-G-Quadruplex: Hinweise auf sequentielle C−H⋅⋅⋅O-Wasserstoffbrücken als Beitrag zur RNA-Quadruplex-Faltung

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• 作者：Jonathan Dickerhoff ; Dr. Bettina Appel ; Prof. Dr. Sabine Mü ; ller and Prof. Dr. Klaus Weisz
• 刊名：Angewandte Chemie
• 出版年：2016
• 出版时间：November 21, 2016
• 年：2016
• 卷：128
• 期：48
• 页码：15386-15390
• 全文大小：888K
• ISSN：1521-3757

文摘

DNA-G-Quadruplexe wurden systematisch an anti-dG-Positionen mit einzelnen Riboguanosin-Bausteinen (rG) modifiziert. Zirkulardichroismus- und NMR-Experimente bestätigen den Erhalt der nativen Quadruplex-Topologie für den Großteil der DNA-RNA-Hybridstrukturen. Veränderungen in der C8-chemischen Verschiebung von Guanosinen an der 3′-Seite einer rG-Substitution im Quadruplex-Kern legen C8-H⋅⋅⋅O-Wasserstoffbrücken mit dem O2′ des C2′-endo-Ribonukleotids nahe. Eine geometrische Analyse bekannter, hochaufgelöster Strukturen deutet darauf hin, dass entsprechende Wechselwirkungen ein allgemeineres Merkmal in RNA-Quadruplexen sind und möglicherweise zur beobachteten Präferenz für parallele Topologien beitragen.