Étude des polymorphismes géniques plaquettaires : discordance phénotype - génotype et impact de techniques standardisées sur l’interprétation du génotypage des alloantigènes plaquettaires humains (HPA)
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文摘
Le diagnostic des thrombopénies alloimmunes repose sur la caractérisation des alloanticorps et la corrélation de leurs spécificités avec le phénotype HPA des patients. Le phénotypage des plaquettes permet d’identifier directement ces alloantigènes mais requière : (1) l’utilisation de sérums de référence qui peuvent être rares, et (2) une quantité minimale de plaquettes difficile à obtenir chez les patients très thrombopéniques et les nouveau-nés. De ce fait, les tests de génotypage sont couramment utilisés comme seule technique d’identification des alloantigènes. Au-delà des variations liées aux systèmes HPA (28 systèmes bi-alléliques (http ://www.ebi.ac.uk/ipd/hpa/), les gènes sont polymorphes. La dbSNP (http ://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?locusId=3690) rapporte 1244 variations du gène ITGB3 codant pour la β3 (ou GPIIIa). Ces variants peuvent fausser les génotypages HPA et les rendre discordants avec les phénotypes identifiés. De telles discordances ont été observées pour les systèmes HPA-1, -2 et -5 (Perichon et al., 1996 ; Bertrand et al., 2006, 2010 et 2013, Nogues et al., 2013 and Conti et al., 2014). Les techniques courantes de génotypage basées sur la PCR (séquençage, PCR-RFLP, PCR-ASA (ou SSP) et Beadchips) peuvent être affectées. Une mutation inconnue localisée dans la zone d’hybridation des amorces peut bloquer l’amplification indépendamment du polymorphisme HPA étudié. Dans les techniques type PCR-ASO, ces mutations peuvent bloquer l’hybridation de la sonde spécifique. Dans ce contexte et en absence de phénotypage, il est recommandé d’utiliser conjointement deux techniques de génotypages dont les amorces ciblent des séquences différentes du gène d’intérêt.
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