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1.CIDER: Resources to Analyze Sequence-Ensemble Relationships of Intrinsically Disordered Proteins

作者：Alex S. Holehouse¹ ; ^{alex.holehouse@wustl.edu} ; Rahul K. Das¹ ; James N. Ahad¹ ; Mary O.G. Richardson¹ ; Rohit V. Pappu¹ ; ^{pappu@wustl.edu}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

2.Characterization of the Conformational Ensemble of Polyglutamine Peptides via Metadynamics MD Simulations and UV Resonance Raman Spectroscopy

作者：Riley J. Workman¹ ; David Punihaole² ; Ryan S. Jakubek² ; Jeffry D. Madura¹

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

3.Error assessment in molecular dynamics trajectories using computed NMR chemical shifts

作者：David R. Koes ; John K. Vries ; ^{vriesjk@pitt.edu}

关键词：Molecular dynamics ; Chemical shift ; Peptide bonds ; Force fields

刊名：Computational and Theoretical Chemistry

出版年：2017

4.Elucidation of Single Hydrogen Bonds in GTPases via Experimental and Theoretical Infrared Spectroscopy

作者：Daniel Mann¹ ; Udo Hö ; weler² ; Carsten Kö ; tting¹ ; ^{carsten.koetting@rub.de} ; Klaus Gerwert¹ ; ³ ; ^{gerwert@bph.rub.de}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

5.Conformational Selection in a Protein-Protein Interaction Revealed by Dynamic Pathway Analysis

作者：Kalyan S. Chakrabarti¹ ; ² ; ⁵ ; ⁶ ; Roman V. Agafonov¹ ; ² ; ⁵ ; Francesco Pontiggia¹ ; ² ; Renee Otten¹ ; ² ; Matthew K. Higgins³ ; Gebhard F.X. Schertler⁴ ; Daniel D. Oprian² ; ^{oprian@brandeis.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Dorothee Kern¹ ; ² ; ^{dkern@brandeis.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：conformational ensemble ; conformational selection ; energy landscape ; molecular recognition dynamics ; protein/protein interaction ; recoverin

刊名：Cell Reports

出版年：2016

6.Dynamic conformational ensembles regulate casein kinase-1 isoforms: Insights from molecular dynamics and molecular docking studies

作者：Surya Pratap Singh^a ; ^{suryabioinfo@gmail.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Dwijendra K. Gupta^b ; ¹

关键词：Wnt signaling pathway ; Molecular dynamics simulation ; Principal component analysis

刊名：Computational Biology and Chemistry

出版年：2016

7.Mapping the Accessible Conformational Landscape of an Insect Carboxylesterase Using Conformational Ensemble Analysis and Kinetic Crystallography

作者：Galen J. Correy¹ ; Paul D. Carr¹ ; Tamara Meirelles¹ ; Peter D. Mabbitt¹ ; Nicholas J. Fraser¹ ; Martin Weik² ; Colin J. Jackson¹ ; ^{colin.jackson@anu.edu.au" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

刊名：Structure

出版年：2016

8.Low resolution solution structure of an enzymatic active AhpC₁₀:AhpF₂ ensemble of the Escherichia coli Alkyl hydroperoxide Reductase

作者：Neelagandan Kamariah^a ; ¹ ; Wilson Nartey^b ; ¹ ; Birgit Eisenhaber^a ; Frank Eisenhaber^a ; ^c ; ^d ; Gerhard Grü ; ber^a ; ^b ; ^{ggrueber@ntu.edu.sg" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Bioenergetics ; Reactive Oxygen Species ; Oxidative stress ; Alkyl hydroperoxide Reductase ; Redox homeostasis ; Small angle X-ray scattering

刊名：Journal of Structural Biology

出版年：2016

9.Mutation-Induced Population Shift in the MexR Conformational Ensemble Disengages DNA Binding: A Novel Mechanism for MarR Family Derepression

作者：Madhanagopal Anandapadamanaban¹ ; ⁵ ; Robert Pilstå ; l² ; ⁵ ; Cecilia Andresen¹ ; Jill Trewhella¹ ; ³ ; Martin Moche⁴ ; Bjö ; rn Wallner² ; ⁶ ; Maria Sunnerhagen¹ ; ⁶ ; ^{maria.sunnerhagen@liu.se" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

刊名：Structure

出版年：2016

10.Dynamic relationships between ribosomal conformational and RNA positional changes during ribosomal translocation

作者：Ping Xie ; ^{pxie@aphy.iphy.ac.cn}

关键词：Biophysics ; Mathematical Bioscience

刊名：Heliyon

出版年：2016

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