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1.A Finer Print Than TADs: PRC1-Mediated Domains

作者：Elena Torlai Triglia¹ ; Tiago Rito¹ ; Ana Pombo¹ ; ^{ana.pombo@mdc-berlin.de}

关键词：Polycomb repressive complex ; PRC1-mediated domains ; Phc1 ; Polycomb bodies ; genome architecture ; chromatin folding ; 5C ; STORM ; embryonic stem cells ; neural progenitors

刊名：Molecular Cell

出版年：2017

2.Mutations in the Chromatin Regulator Gene BRPF1 Cause Syndromic Intellectual Disability and Deficient Histone Acetylation

作者：Kezhi Yan¹ ; ¹⁷ ; Justine Rousseau² ; ¹⁷ ; Rebecca Okashah Littlejohn³ ; Courtney Kiss⁴ ; Anna Lehman⁵ ; Jill A. Rosenfeld⁶ ; Constance T.R. Stumpel⁷ ; Alexander P.A. Stegmann⁷ ; Laurie Robak⁶ ; Fernando Scaglia⁶ ; Thi Tuyet Mai Nguyen² ; He Fu² ; Norbert F. Ajeawung² ; Maria Vittoria Camurri² ; Lin Li¹ ; Alice Gardham⁸ ; Bianca Panis⁹ ; Mohammed Almannai⁶ ; Maria J. Guillen Sacoto¹⁰ ; Berivan Baskin¹⁰ ; Claudia Ruivenkamp¹¹ ; Fan Xia⁶ ; Weimin Bi⁶ ; DDD Study¹²

关键词：developmental disorder ; intellectual disability ; epigenetic regulator ; bromodomain ; BRPF2 ; PHD finger ; PWWP domain ; PZP domain ; histone acetylation

刊名：The American Journal of Human Genetics

出版年：2017

3.Polycomb Repressive Complex 1 Generates Discrete Compacted Domains that Change during Differentiation

作者：Sharmistha Kundu¹ ; ² ; Fei Ji¹ ; ² ; Hongjae Sunwoo¹ ; ² ; Gaurav Jain⁵ ; Jeannie T. Lee¹ ; ² ; ³ ; ⁴ ; Ruslan I. Sadreyev¹ ; ³ ; Job Dekker⁴ ; ⁵ ; Robert E. Kingston¹ ; ² ; ⁶ ; ^{kingston@molbio.mgh.harvard.edu}

关键词：Polycomb ; PRC1 ; compaction ; chromatin ; 5C ; STORM ; higher-order structure ; cell fate ; differentiation

刊名：Molecular Cell

出版年：2017

4.Visualization of Chromatin Decompaction and Break Site Extrusion as Predicted by Statistical Polymer Modeling of Single-Locus Trajectories

作者：Assaf Amitai¹ ; ² ; ⁶ ; Andrew Seeber³ ; ⁴ ; ⁶ ; Susan M. Gasser³ ; ⁴ ; ⁷ ; ^{susan.gasser@fmi.ch} ; David Holcman¹ ; ⁵ ; ^{david.holcman@ens.fr}

关键词：chromatin dynamics ; nucleosome compaction ; polymer model ; double-strand break ; actin cytoskeleton ; microtubules ; time-lapse imaging ; DNA damage ; DNA mobility ; numerical stimulations

刊名：Cell Reports

出版年：2017

5.The SWI2/SNF2 Chromatin-Remodeling ATPase BRAHMA Regulates Chlorophyll Biosynthesis in Arabidopsis

作者：Dong Zhang¹ ; ² ; ³ ; Yuhong Li¹ ; ² ; ³ ; Xinyu Zhang¹ ; ² ; Ping Zha¹ ; ² ; Rongcheng Lin¹ ; ² ; ^{rclin@ibcas.ac.cn}

关键词：chromatin remodeling ; chlorophyll biosynthesis ; light signaling ; PIF1 ; PORC

刊名：Molecular Plant

出版年：2017

6.TRF2 recruits ORC through TRFH domain dimerization

作者：Mitsunori Higa^a ; Tatsunori Kushiyama^a ; Seiichiro Kurashige^a ; Daisuke Kohmon^a ; Kouki Enokitani^a ; Satoko Iwahori^b ; Nozomi Sugimoto^a ; Kazumasa Yoshida^a ; ^{kyoshida@phar.kyushu-u.ac.jp} ; Masatoshi Fujita^a ; ^{mfujita@phar.kyushu-u.ac.jp}

关键词：TRF2 ; telomeric repeat binding factor 2 ; ORC ; origin recognition complex ; TRFH ; TRF homology ; pre-RC ; pre-replication complex ; G4 ; G-quadruplex ; TRF1 ; telomeric repeat binding factor 1 ; lacO ; lac operator ; LacI ; lac repressor ; ChIP ; chromatin immunoprecipitation ; qPCR ; quantitative real-time PCR ; H3K9me3 ; histone H3 trimethylated at K9 ; TERRA ; telomeric repeat-containing RNA

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research

出版年：2017

7.Not All H3K4 Methylations Are Created Equal: Mll2/COMPASS Dependency in Primordial Germ Cell Specification

作者：Deqing Hu¹ ; ² ; Xin Gao² ; Kaixiang Cao¹ ; Marc A. Morgan¹ ; Gloria Mas³ ; ⁴ ; Edwin R. Smith¹ ; Andrew G. Volk¹ ; ⁵ ; Elizabeth T. Bartom¹ ; John D. Crispino¹ ; ⁵ ; ⁷ ; Luciano Di Croce³ ; ⁴ ; ⁶ ; Ali Shilatifard¹ ; ² ; ⁷ ; ⁸ ; ^{ash@northwestern.edu}

关键词：Histone-Lysine N-Methyltransferase ; chromatin ; histone ; mouse embryonic stem cell ; embryonic development ; primordial germ cell ; gene expression regulation ; Mll2 ; Kmt2b ; CXXC domain

刊名：Molecular Cell

出版年：2017

8.Interdomain Communication of the Chd1 Chromatin Remodeler across the DNA Gyres of the Nucleosome

作者：Ilana M. Nodelman¹ ; Franziska Bleichert² ; ³ ; Ashok Patel¹ ; ⁴ ; Ren Ren¹ ; Kyle C. Horvath¹ ; James M. Berger² ; Gregory D. Bowman¹ ; ⁵ ; ^{gdbowman@jhu.edu}

关键词：chromatin remodeling ; nucleosome sliding ; chromodomains ; SF2 ATPase ; superhelical location 2 ; SHL2 ; DNA unwrapping ; nucleosome assembly ; CHD remodeler ; ISWI remodeler

刊名：Molecular Cell

出版年：2017

9.Retrieving Chromatin Patterns from Deep Sequencing Data Using Correlation Functions

作者：Jana Molitor¹ ; Jan-Philipp Mallm¹ ; Karsten Rippe¹ ; ^{karsten.rippe@dkfz.de} ; Fabian Erdel¹ ; ^{f.erdel@dkfz.de}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

10.Gene-regulatory networks controlling inflorescence and flower development in Arabidopsis thaliana

作者：Christopher Ralf Wils ; Kerstin Kaufmann ; ^{kerstin.kaufmann@uni-potsdam.de}

关键词：TF ; transcription factor ; MADS ; MCM1 ; AGAMOUS ; DEFICIENS ; SRF ; SEP ; SEPALLATA ; ChIP-seq ; chromatin immunoprecipitation followed by deep sequencing ; PcG ; Polycomb group ; H3K27me3 ; histone 3 lysine 27 tri-methylation ; PRC ; polycomb repressive complex ; trxG ; trithorax group ; SAND domain ; Sp100 ; AIRE-1 ; NucP41/75 ; DEAF-1 domain ; ULT ; ULTRAPETALA ; miRNA ; microRNA ; AP2 ; APETALA2 ; FLC ; FLOWERING LOCUS C ; SOC1 ; SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS1 ; FT ; FLOWERING LOCUS T ; FD ; FLOWERING LOCUS D ; IM

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

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