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1.Histone Acetylation Regulates Chromatin Accessibility: Role of H4K16 in Inter-nucleosome Interaction

作者：Ruihan Zhang¹ ; Jochen Erler¹ ; Jö ; rg Langowski¹ ; ^jl@dkfz.de

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

2.Visualization of Chromatin Decompaction and Break Site Extrusion as Predicted by Statistical Polymer Modeling of Single-Locus Trajectories

作者：Assaf Amitai¹ ; ² ; ⁶ ; Andrew Seeber³ ; ⁴ ; ⁶ ; Susan M. Gasser³ ; ⁴ ; ⁷ ; ^{susan.gasser@fmi.ch} ; David Holcman¹ ; ⁵ ; ^{david.holcman@ens.fr}

关键词：chromatin dynamics ; nucleosome compaction ; polymer model ; double-strand break ; actin cytoskeleton ; microtubules ; time-lapse imaging ; DNA damage ; DNA mobility ; numerical stimulations

刊名：Cell Reports

出版年：2017

3.Investigation of the interaction between berberine and nucleosomes in solution: Spectroscopic and equilibrium dialysis approach

作者：Azra Rabbani-Chadegani ; ^{arabbani@ut.ac.ir} ; Hossein Mollaei ; Javad Sargolzaei

关键词：Berberine ; Nucleosomes ; Chromatin ; Histones ; Spectroscopy ; Plant alkaloids

刊名：Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy

出版年：2017

4.Human PRE-PIK3C2B, an intronic cis-element with dual function of activation and repression

作者：Jayant Maini^a ; Mohsen Ghasemi^a ; Deepti Yandhuri^b ; Suman S. Thakur^b ; Vani Brahmachari^a ; ^{vani.brahmachari@gmail.com}

关键词：Human PRE-TRE ; MLL ; Regulation ; Polycomb and trithorax ; Chromatin interaction ; Genetic interaction

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

5.Retrieving Chromatin Patterns from Deep Sequencing Data Using Correlation Functions

作者：Jana Molitor¹ ; Jan-Philipp Mallm¹ ; Karsten Rippe¹ ; ^{karsten.rippe@dkfz.de} ; Fabian Erdel¹ ; ^{f.erdel@dkfz.de}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

6.Linking Chromatin Fibers to Gene Folding by Hierarchical Looping

作者：Gavin Bascom¹ ; Tamar Schlick¹ ; ² ; ³ ; ^{schlick@nyu.edu}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

7.Studying nuclear functions of aminoacyl tRNA synthetases

作者：Yi Shi^a ; ^b ; ^{yishi@scripps.edu} ; ^{yishi@nankai.edu.cn} ; Na Wei^a ; Xiang-Lei Yang^a ; ^{xlyang@scripps.edu}

关键词：Aminoacyl tRNA synthetase ; Nuclear function ; Transcriptional regulation cell fractionation ; Chromatin immunoprecipitation

刊名：Methods

出版年：2017

8.TRF2 recruits ORC through TRFH domain dimerization

作者：Mitsunori Higa^a ; Tatsunori Kushiyama^a ; Seiichiro Kurashige^a ; Daisuke Kohmon^a ; Kouki Enokitani^a ; Satoko Iwahori^b ; Nozomi Sugimoto^a ; Kazumasa Yoshida^a ; ^{kyoshida@phar.kyushu-u.ac.jp} ; Masatoshi Fujita^a ; ^{mfujita@phar.kyushu-u.ac.jp}

关键词：TRF2 ; telomeric repeat binding factor 2 ; ORC ; origin recognition complex ; TRFH ; TRF homology ; pre-RC ; pre-replication complex ; G4 ; G-quadruplex ; TRF1 ; telomeric repeat binding factor 1 ; lacO ; lac operator ; LacI ; lac repressor ; ChIP ; chromatin immunoprecipitation ; qPCR ; quantitative real-time PCR ; H3K9me3 ; histone H3 trimethylated at K9 ; TERRA ; telomeric repeat-containing RNA

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research

出版年：2017

9.Forging Ahead through Darkness: PCNA, Still the Principal Conductor at the Replication Fork

作者：Katherine N. Choe¹ ; ² ; George-Lucian Moldovan¹ ; ³ ; ^{glm29@psu.edu}

关键词：PCNA ; DNA replication ; DNA repair ; genomic stability ; translesion synthesis ; ubiquitin ; SUMO ; chromatin

刊名：Molecular Cell

出版年：2017

10.Cellular responses to replication stress: Implications in cancer biology and therapy

作者：Hui-Ju Hsieh ; ^{hhsieh@mdanderson.org} ; Guang Peng

关键词：53BP1 ; tumor protein p53 binding protein 1 ; 9-1-1 ; RAD9-RAD1-HUS1 ; AND1 ; acidic nucleoplasmic DNA-binding protein 1 ; ATR ; ataxia telangiectasia and Rad3 related ; ATRIP ; ATR interacting protein ; BIR ; break-induced replication ; BLM (RECQL3) ; Bloom Syndrome ; CDC6/7/45 ; cell division cycle 6/7/45 ; CDK1/2/4/6/7 ; cyclin-dependent kinase 1/2/4/6/7 ; CDT1 ; chromatin licensing and DNA replication factor 1 ; CFSs ; common fragile sites ; CHK1/2 ; checkpoint kinase 1/2 ; CMG ; CDC45-MCM-GINS ; CTIP ; CTBP-interacti

刊名：DNA Repair

出版年：2017

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