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1. Chrom3D: three-dimensional genome modeling from Hi-C and nuclear lamin-genome contacts

作者： Jonas Paulsen ; Monika Sekelja ; Anja R. Oldenburg ; Alice Barateau…

关键词：Three ; dimensional (3D) genome ; HiC ; Lamin ; associated domain (LAD) ; Laminopathy ; Modeling ; Nuclear lamin ; Topologically ; associated domain (TAD)

刊名：Genome Biology

出版年：2017

2. The mitochondrial genome of Octostruma stenognatha and its phylogenetic implications

作者： P. R. Ströher ; E. Zarza ; W. L. E. Tsai ; J. E. McCormack ; R. M. Feitosa…

关键词：Mitogenome ; Ultraconserved elements ; Formicidae ; Ants

刊名：Insectes Sociaux

出版年：2017

3. Genome-wide methylation data mirror ancestry information

作者： Elior Rahmani ; Liat Shenhav ; Regev Schweiger ; Paul Yousefi…

关键词：DNA methylation ; Population structure ; Ancestry ; Epigenetics ; Epigenome ; wide association study (EWAS) ; Illumina 450K

刊名：Epigenetics & Chromatin

出版年：2017

4. Molecular dissection of germline chromothripsis in a developmental context using patient-derived iPS cells

作者： Sjors Middelkamp ; Sebastiaan van Heesch ; A. Koen Braat ; Joep de Ligt…

关键词：Chromothripsis ; Complex genomic rearrangements ; Congenital disorders ; Induced pluripotent stem cells ; Neuronal differentiation ; RNA ; sequencing ; Chromosome conformation capture ; TWIST1 ; Craniosynostosis ; Personal genomics

刊名：Genome Medicine

出版年：2017

5. McrA primers for the detection and quantification of the anaerobic archaeal methanotroph ‘Candidatus Methanoperedens nitroreducens’

作者： Annika Vaksmaa ; Mike S. M. Jetten…

关键词：‘Candidatus Methanoperedens nitroreducens’Anaerobic oxidation of methane ; ANME ; mcrA

刊名：Applied Microbiology and Biotechnology

出版年：2017

6. Laser capture microdissection microscopy and genome sequencing of the avian malaria parasite, Plasmodium relictum

作者： Holly L. Lutz ; Nicholas J. Marra ; Felix Grewe ; Jenny S. Carlson…

关键词：Avian malaria ; Plasmodium genome ; laser capture microdissection microscopy

刊名：Parasitology Research

出版年：2016

7. Horizontal transfer of a novel Helentron in insects

作者： Hua-Hao Zhang ; Guo-Yin Li ; Xiao-Min Xiong ; Min-Jin Han…

关键词：Horizontal transfer ; Helentrons ; Insects

刊名：Molecular Genetics and Genomics

出版年：2017

8. Patterns of additive genotype-by-environment interaction in tree height of Norway spruce in southern and central Sweden

作者： Zhi-Qiang Chen ; Bo Karlsson ; Harry X. Wu

关键词：Picea abies ; Factor analysis ; MET ; Cluster analysis ; G × E interaction

刊名：Tree Genetics & Genomes

出版年：2017

9. Towards new sources of resistance to the currant-lettuce aphid (Nasonovia ribisnigri)

作者： Peter G. Walley ; Gemma Hough ; Jonathan D. Moore ; John Carder…

关键词：Lettuce ; Diversity ; SNP ; Aphid ; Association ; Resistance

刊名：Molecular Breeding

出版年：2017

10. HiC-bench: comprehensive and reproducible Hi-C data analysis designed for parameter exploration and benchmarking

作者： Charalampos Lazaris ; Stephen Kelly ; Panagiotis Ntziachristos…

关键词：HiC ; Chromosome conformation ; Computational pipeline ; Data provenance ; Parameter exploration ; Benchmarking

刊名：BMC Genomics

出版年：2017

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