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1. A Method for the Annotation of Functional Similarities of Coding DNA Sequences: the Case of a Populated Cluster of Transmembrane Proteins

作者： Miguel Angel Fuertes ; José Ramón Rodrigo ; Carlos Alonso

关键词：Molecular evolution ; Gene ontology ; Triplet composon ; Gene clustering

刊名：Journal of Molecular Evolution

出版年：2017

2. Metazoan evolution of the armadillo repeat superfamily

作者： Ismail Sahin Gul ; Paco Hulpiau ; Yvan Saeys…

关键词：Phylogeny ; ARM repeat ; HEAT repeat ; Metazoa ; Premetazoan ; Molecular evolution ; Protein domains ; Catenins ; Importins

刊名：Cellular and Molecular Life Sciences

出版年：2017

3. Genome-wide mining, characterization, and development of microsatellite markers in Marsupenaeus japonicus by genome survey sequencing

作者： Xia Lu 卢霞 ; Sheng Luan 栾生 ; Jie Kong 孔杰…

关键词：Marsupenaeus japonicus ; genome ; wide SSR markers ; genome survey sequencing ; functional annotation

刊名：Chinese Journal of Oceanology and Limnology

出版年：2017

4. GBS-based single dosage markers for linkage and QTL mapping allow gene mining for yield-related traits in sugarcane

作者： Thiago Willian Almeida Balsalobre ; Guilherme da Silva Pereira…

关键词：Saccharum spp ; Polyploidy ; SNPs ; Molecular markers ; Allelic dosage ; Quantitative traits

刊名：BMC Genomics

出版年：2017

5. Genomic analysis of the multi-drug-resistant clinical isolate Myroides odoratimimus PR63039

作者： Shaohua Hu ; Tao Jiang ; Yajun Zhou ; Desong Ming…

关键词：Myroides odoratimimus ; Complete genome sequencing ; Resistance gene ; Antibiotic resistance mechanisms

刊名：Molecular Genetics and Genomics

出版年：2017

6. Transcriptomic analysis of Casuarina equisetifolia L. in responses to cold stress

作者： Hai-Bo Li ; Nan Li ; Shao-Zong Yang ; Hua-Zheng Peng ; Li-Ling Wang…

关键词：Casuarina equisetifolia L. ; Cold stress ; Transcriptome ; Gene expression ; RNA ; Seq

刊名：Tree Genetics & Genomes

出版年：2017

7. Comparative genomic analysis of eutherian tumor necrosis factor ligand genes

作者： Marko Premzl

关键词：Comparative genomic analysis ; Gene annotations ; Molecular evolution ; Phylogenetic analysis

刊名：Immunogenetics

出版年：2016

8. Identifying novel protein phenotype annotations by hybridizing protein–protein interactions and protein sequence similarities

作者： Lei Chen ; Yu-Hang Zhang ; Tao Huang ; Yu-Dong Cai

关键词：Phenotype ; Protein–protein interaction ; Protein sequence similarity ; Shortest path algorithm

刊名：Molecular Genetics and Genomics

出版年：2016

9. Integrating network, sequence and functional features using machine learning approaches towards identification of novel Alzheimer genes

作者： Salma Jamal ; Sukriti Goyal ; Asheesh Shanker ; Abhinav Grover

关键词：Alzheimer ; associated genes ; Machine learning ; Interaction networks ; Sequence features ; Functional annotations ; Molecular docking ; Molecular dynamics

刊名：BMC Genomics

出版年：2016

10. Transcriptome analysis in Coffea eugenioides, an Arabica coffee ancestor, reveals differentially expressed genes in leaves and fruits

作者： Priscila Mary Yuyama ; Osvaldo Reis Júnior…

关键词：Coffea ; RNA ; seq ; Gene annotation ; Differentially expressed genes ; Homeologous

刊名：Molecular Genetics and Genomics

出版年：2016

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