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1. Design of novel polymeric adsorbents for metal ion removal from water using computer-aided molecular design

作者： Rajib Mukherjee ; Berhane Gebreslassie…

关键词：Chelating resin ; Heavy metal ions ; Group contribution method (GCM) ; Adsorbate–solid solution theory (ASST) ; Computer ; aided molecular design (CAMD) ; Efficient ant colony optimization (EACO)

刊名：Clean Technologies and Environmental Policy

出版年：2017

2. Overview of the SAMPL5 host–guest challenge: Are we doing better?

作者： Jian Yin ; Niel M. Henriksen…

关键词：Host–guest ; Molecular recognition ; Computer ; aided drug design ; Blind challenge ; Binding affinity

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

3. Lessons learned from comparing molecular dynamics engines on the SAMPL5 dataset

作者： Michael R. Shirts ; Christoph Klein…

关键词：Molecular dynamics ; Simulation validation ; Molecular simulation ; SAMPL5

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

4. Pharmacoinformatics and molecular docking studies reveal potential novel Proline Dehydrogenase (PRODH) compounds for Schizophrenia inhibition

作者： Sheikh Arslan Sehgal

关键词：Schizophrenia ; Pharmacophore identification ; Structure prediction and molecular Docking ; PRODH ; Virtual screening ; Computer ; aided drug designing

刊名：Medicinal Chemistry Research

出版年：2017

5. Docking and molecular dynamics studies on triclosan derivatives binding to FabI

作者： Xuyun Yang ; Junrui Lu ; Ming Ying ; Jiangbei Mu ; Peichun Li…

关键词：Enoyl ; ACP reductase ; MM ; PBSA ; Molecular dynamics simulation ; Triclosan

刊名：Journal of Molecular Modeling

出版年：2017

6. Absolute binding free energies for octa-acids and guests in SAMPL5

作者： Florentina Tofoleanu ; Juyong Lee…

关键词：Binding free energy simulations ; Thermodynamic integration ; Hamiltonian replica exchange ; Bennett acceptance ratio ; Double decoupling method ; Molecular dynamics simulations ; GalaxyDock ; HG

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

7. Design Perspectives of an Evolutionary Process for Multi-objective Molecular Optimization

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2017

8. On the fly estimation of host–guest binding free energies using the movable type method: participation in the SAMPL5 blind challenge

作者： Nupur Bansal ; Zheng Zheng ; David S. Cerutti…

关键词：SAMPL5 ; Blind challenge ; Binding free energy ; Movable type ; Octa ; acid ; Cucurbituril

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

9. Blinded predictions of host-guest standard free energies of binding in the SAMPL5 challenge

作者： Stefano Bosisio ; Antonia S. J. S. Mey…

关键词：SAMPL5 ; Binding free energies ; Host ; guest systems

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

10. Absolute binding free energy calculations of CBClip host–guest systems in the SAMPL5 blind challenge

作者： Juyong Lee ; Florentina Tofoleanu…

关键词：Absolute binding free energy calculation ; Hamiltonian replica exchange ; Thermodynamic integration ; Bennett’s acceptance ratio ; Double decoupling scheme ; Host ; guest complexes ; Constant ; pH simulation

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

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