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1. Binding free energies in the SAMPL5 octa-acid host–guest challenge calculated with DFT-D3 and CCSD(T)

作者： Octav Caldararu ; Martin A. Olsson…

关键词：Ligand ; binding affinities ; Host–guest systems ; Density ; functional theory ; Dispersion corrections ; COSMO ; RS ; DLPNO–CCSD(T) ; SAMPL5

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

2. On the fly estimation of host–guest binding free energies using the movable type method: participation in the SAMPL5 blind challenge

作者： Nupur Bansal ; Zheng Zheng ; David S. Cerutti…

关键词：SAMPL5 ; Blind challenge ; Binding free energy ; Movable type ; Octa ; acid ; Cucurbituril

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

3. Absolute binding free energies for octa-acids and guests in SAMPL5

作者： Florentina Tofoleanu ; Juyong Lee…

关键词：Binding free energy simulations ; Thermodynamic integration ; Hamiltonian replica exchange ; Bennett acceptance ratio ; Double decoupling method ; Molecular dynamics simulations ; GalaxyDock ; HG

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

4. The crystal structure of the AgamOBP1•Icaridin complex reveals alternative binding modes and stereo-selective repellent recognition

作者： Christina E. Drakou ; Katerina E. Tsitsanou…

关键词：Anopheles gambiae ; Odorant binding protein ; Repellents ; Icaridin ; DEET ; Stereoselectivity

刊名：Cellular and Molecular Life Sciences

出版年：2017

5. A combined treatment of hydration and dynamical effects for the modeling of host–guest binding thermodynamics: the SAMPL5 blinded challenge

作者： Rajat Kumar Pal ; Kamran Haider ; Divya Kaur…

关键词：SAMPL5 ; Hydration Site Analysis (HSA) ; Debye–Hückel ; Salt effects ; AGBNP2 ; BEDAM

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

6. Neurochemical binding profiles of novel indole and benzofuran MDMA analogues

作者： Jakob A. Shimshoni ; Ilan Winkler…

关键词：34 ; MethylenedioxyN ; methylamphetamine (MDMA) ; MDMA analogues ; Neurochemical profile ; Monoamine receptors ; Monoamine transporters

刊名：Naunyn-Schmiedeberg's Archives of Pharmacology

出版年：2017

7. Overview of the SAMPL5 host–guest challenge: Are we doing better?

作者： Jian Yin ; Niel M. Henriksen…

关键词：Host–guest ; Molecular recognition ; Computer ; aided drug design ; Blind challenge ; Binding affinity

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

8. Identification of (1H-indol-3-yl)(2,2,3,3-tetramethylcyclopropyl)methanone (DP-UR-144) in a herbal drug product that was commercially available in the Tokyo metropolitan area

作者： Yoko Ichikawa ; Jun’ichi Nakajima ; Misako Takahashi ; Nozomi Uemura…

关键词：(1H ; Indol3 ; yl)(2233 ; tetramethylcyclopropyl)methanone (DP ; UR ; 144) ; FUB ; 144 ; Synthetic cannabinoid ; [35S]GTPγS binding assays ; Small amounts of drugs having psychotropic activities

刊名：Forensic Toxicology

出版年：2017

9. Application of isothermal titration calorimetry in evaluation of protein–nanoparticle interactions

作者： Enisa Omanovic-Miklicanin ; Iain Manfield…

关键词：Isothermal titration calorimetry ; Nanoparticles ; Proteins ; Interactions ; Gold nanoparticles ; Protein–nanoparticle interaction

刊名：Journal of Thermal Analysis and Calorimetry

出版年：2017

10. Role of HLA-DP in the Presentation of Epitopes from the Truncated Bacterial PE38 Immunotoxin

作者： Ronit Mazor ; Selamawit Addissie ; Youjin Jang ; Chin-Hsien Tai…

关键词：KEY WORDSDP ; epitope prediction ; HLA class II ; in silico ; MHC class IIT ; cell epitopes

刊名：The AAPS Journal

出版年：2017

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