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1. The use of genome-scale metabolic network reconstruction to predict fluxes and equilibrium composition of N-fixing versus C-fixing cells in a diazotrophic cyanobacterium, Trichodesmium erythraeum

作者： Joseph J. Gardner ; Nanette R. Boyle

关键词：Flux balance analysis ; Constraints based modeling ; Flux variability analysis ; Nitrogen cycle ; Diazotrophy ; Marine cyanobacteria

刊名：BMC Systems Biology

出版年：2017

2. Reconstruction of a composite comparative map composed of ten legume genomes

作者： Chaeyoung Lee ; Dongwoon Yu ; Hong-Kyu Choi ; Ryan W. Kim

关键词：Legumes ; Comparative genomics ; Gene ; specific marker ; Synteny

刊名：Genes & Genomics

出版年：2017

3. Survey of (Meta)genomic Approaches for Understanding Microbial Community Dynamics

作者： Anukriti Sharma ; Rup Lal

关键词：Metagenomics ; Genomics ; De novo ; Genome reconstruction ; Recruitments

刊名：Indian Journal of Microbiology

出版年：2017

4. Genome-wide identification, characterisation and expression profiles of calcium-dependent protein kinase genes in barley (Hordeum vulgare L.)

作者： Olga Fedorowicz-Strońska ; Grzegorz Koczyk…

关键词：Calcium ; dependent protein kinases (CDPKs) ; Drought stress ; Gene expression ; Hordeum vulgare ; Phylogenetic analysis

刊名：Journal of Applied Genetics

出版年：2017

5. Evolutionary history of versatile-lipases from Agaricales through reconstruction of ancestral structures

作者： Jorge Barriuso ; María Jesús Martínez

关键词：Enzyme ancestors ; Candida rugosa ; like lipases ; Genome sequencing

刊名：BMC Genomics

出版年：2017

6. A mixed-integer linear programming approach to the reduction of genome-scale metabolic networks

作者： Annika Röhl ; Alexander Bockmayr

关键词：Constraint ; based modeling ; Model reduction ; Stoichiometric models ; Mixed ; integer linear programming ; Metabolic networks

刊名：BMC Bioinformatics

出版年：2017

7. Unravelling genetic diversity and cultivar parentage in the Danish apple gene bank collection

作者： Bjarne Larsen ; Torben Bo Toldam-Andersen ; Carsten Pedersen…

关键词：Malus domestica cultivars ; Germplasm ; Pedigree ; Genetic structure ; Microsatellites ; Ploidy

刊名：Tree Genetics & Genomes

出版年：2017

8. EAGER: efficient ancient genome reconstruction

作者： Alexander Peltzer ; Günter Jäger ; Alexander Herbig ; Alexander Seitz…

关键词：aDNA ; Bioinformatics ; Authentication ; aDNA analysis ; Genome reconstruction

刊名：Genome Biology

出版年：2016

9. Phylogenetic signal in phenotypic traits related to carbon source assimilation and chemical sensitivity in Acinetobacter species

作者： Ado Van Assche ; Sergio Álvarez-Pérez…

关键词：Biolog ; GENIII ; Phenotypic and phylogenetic diversity ; rpoB

刊名：Applied Microbiology and Biotechnology

出版年：2017

10. Microbial communities in pyrene amended soil–compost mixture and fertilized soil

作者： Iris K. U. Adam ; Márcia Duarte ; Jananan Pathmanathan ; Anja Miltner…

关键词：Biodegradation ; Pyrene ; Stable isotope probing ; RNA ; DNA ; Microbial communities ; Compost ; Farmyard manure

刊名：AMB Express

出版年：2017

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