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1.Discovery of a regioselectivity switch in nitrating P450s guided by molecular dynamics simulations and Markov models

作者：Sheel C. Dodani ; Gert Kiss ; Jackson K. B. Cahn ; Ye Su ; Vijay S. Pande ; Frances H. Arnold

关键词：Enzymes ; Molecular dynamics ; Biocatalysis

刊名：Nature Chemistry

出版年：2016

2.Molecular dynamics simulation of telomeric single-stranded DNA and POT1 Open

作者：Masaaki Kaburagi ; Hironao Yamada ; Takeshi Miyakawa ; Ryota Morikawa ; Masako Takasu ; Takamitsu A Kato and Mitsuru Uesaka

关键词：Polymer Journal ; Society of Polymer Science ; Japan ; Polymer Science Society ; Japanese Polymer Society ; Chemical Society of Japan ; Polymer research in Japan ; SPSJ ; JStage ; Polymer ; Official Journal ; Polymer Synthesis ; Polymer Reactions ; Polymer Structure ; Functional Polymers ; Biopolymers ; Polymer Engineering ; Polymerization ; Surface properties

刊名：Polymer Journal

出版年：2016

3.Ab initio molecular dynamics simulation of the effects of stacking faults on the radiation response of 3C-SiC

作者：M. Jiang ; S. M. Peng ; H. B. Zhang ; C. H. Xu ; H. Y. Xiao ; F. A. Zhao ; Z. J. Liu ; X. T. Zu

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

4.Fast diffusion of water nanodroplets on graphene

作者：Ming Ma ; Gabriele Tocci ; Angelos Michaelides ; Gabriel Aeppli

关键词：Molecular dynamics ; Two-dimensional materials

刊名：Nature Materials

出版年：2016

5.Defining the membrane disruption mechanism of kalata B1 via coarse-grained molecular dynamics simulations

作者：Wanapinun Nawae ; Supa Hannongbua ; Marasri Ruengjitchatchawalya

关键词：Computational models ; Molecular modelling

刊名：Scientific Reports

出版年：2014

6.All-atom molecular dynamics analysis of multi-peptide systems reproduces peptide solubility in line with experimental observations

作者：Yutaka Kuroda ; Atsushi Suenaga ; Yuji Sato ; Satoshi Kosuda ; Makoto Taiji

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

7.Unfolding mechanism of thrombin-binding aptamer revealed by molecular dynamics simulation and Markov State Model

作者：Xiaojun Zeng ; Liyun Zhang ; Xiuchan Xiao ; Yuanyuan Jiang ; Yanzhi Guo ; Xinyan Yu ; Xuemei Pu ; Menglong Li

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

8.Docking and molecular dynamics simulations of the ternary complex nisin2:lipid II

作者：Sam Mulholland ; Eleanor R. Turpin ; Boyan B. Bonev ; Jonathan D. Hirst

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

9.Adenylylation of Tyr77 stabilizes Rab1b GTPase in an active state: A molecular dynamics simulation analysis

作者：Manuel P. Luitz ; Rainer Bomblies ; Evelyn Ramcke ; Aymelt Itzen ; Martin Zacharias

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

10.Molecular simulations of conformation change and aggregation of HIV-1 Vpr13-33 on graphene oxide

作者：Songwei Zeng ; Guoquan Zhou ; Jianzhong Guo ; Feng Zhou ; Junlang Chen

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

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